Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DAP3P51398 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DAP3P51398 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DAP3P51398 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DAP3P51398 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DAP3P51398 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DAP3P51398 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DAP3P51398 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DAP3P51398 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DAP3P51398 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DAP3P51398 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DAP3P51398 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DAP3P51398 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DAP3P51398 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DAP3P51398 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DAP3P51398 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DAP3P51398 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DAP3P51398 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DAP3P51398 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DAP3P51398 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DAP3P51398 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DAP3P51398 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DAP3P51398 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DAP3P51398 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DAP3P51398 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DAP3P51398 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DAP3P51398 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DAP3P51398 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DAP3P51398 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DAP3P51398 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DAP3P51398 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DAP3P51398 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DAP3P51398 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DAP3P51398 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DAP3P51398 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DAP3P51398 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DAP3P51398 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DAP3P51398 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DAP3P51398 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DAP3P51398 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DAP3P51398 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DAP3P51398 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DAP3P51398 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DAP3P51398 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DAP3P51398 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DAP3P51398 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DAP3P51398 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DAP3P51398 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DAP3P51398 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DAP3P51398 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DAP3P51398 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DAP3P51398 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DAP3P51398 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DAP3P51398 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DAP3P51398 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DAP3P51398 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DAP3P51398 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DAP3P51398 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DAP3P51398 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DAP3P51398 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DAP3P51398 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DAP3P51398 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DAP3P51398 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DAP3P51398 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DAP3P51398 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DAP3P51398 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DAP3P51398 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DAP3P51398 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DAP3P51398 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DAP3P51398 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DAP3P51398 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DAP3P51398 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DAP3P51398 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DAP3P51398 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DAP3P51398 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DAP3P51398 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DAP3P51398 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DAP3P51398 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
DAP3P51398 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DAP3P51398 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DAP3P51398 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DAP3P51398 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DAP3P51398 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DAP3P51398 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DAP3P51398 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DAP3P51398 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DAP3P51398 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DAP3P51398 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DAP3P51398 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DAP3P51398 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DAP3P51398 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DAP3P51398 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DAP3P51398 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DAP3P51398 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DAP3P51398 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DAP3P51398 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DAP3P51398 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DAP3P51398 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
DAP3P51398 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DAP3P51398 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms