Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARGP37231 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARGP37231 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARGP37231 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARGP37231 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARGP37231 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARGP37231 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARGP37231 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARGP37231 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARGP37231 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARGP37231 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARGP37231 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARGP37231 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARGP37231 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARGP37231 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARGP37231 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARGP37231 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARGP37231 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARGP37231 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARGP37231 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARGP37231 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARGP37231 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARGP37231 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARGP37231 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARGP37231 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARGP37231 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPARGP37231 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPARGP37231 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPARGP37231 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPARGP37231 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPARGP37231 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPARGP37231 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPARGP37231 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPARGP37231 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPARGP37231 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPARGP37231 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPARGP37231 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPARGP37231 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPARGP37231 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPARGP37231 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPARGP37231 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPARGP37231 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPARGP37231 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PPARGP37231 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPARGP37231 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPARGP37231 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PPARGP37231 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPARGP37231 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPARGP37231 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPARGP37231 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPARGP37231 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPARGP37231 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPARGP37231 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPARGP37231 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPARGP37231 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPARGP37231 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPARGP37231 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PPARGP37231 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PPARGP37231 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
PPARGP37231 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PPARGP37231 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PPARGP37231 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PPARGP37231 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PPARGP37231 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PPARGP37231 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PPARGP37231 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PPARGP37231 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PPARGP37231 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PPARGP37231 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PPARGP37231 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PPARGP37231 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PPARGP37231 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PPARGP37231 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PPARGP37231 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PPARGP37231 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PPARGP37231 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PPARGP37231 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PPARGP37231 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PPARGP37231 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PPARGP37231 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PPARGP37231 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PPARGP37231 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PPARGP37231 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PPARGP37231 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPARGP37231 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPARGP37231 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PPARGP37231 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPARGP37231 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPARGP37231 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPARGP37231 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPARGP37231 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPARGP37231 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPARGP37231 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPARGP37231 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPARGP37231 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPARGP37231 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPARGP37231 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPARGP37231 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPARGP37231 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPARGP37231 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms