Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms