Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms