Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERBB3P21860 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ERBB3P21860 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERBB3P21860 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERBB3P21860 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERBB3P21860 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERBB3P21860 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERBB3P21860 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERBB3P21860 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERBB3P21860 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERBB3P21860 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERBB3P21860 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERBB3P21860 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERBB3P21860 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERBB3P21860 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERBB3P21860 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERBB3P21860 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms