Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BGNP21810 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BGNP21810 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BGNP21810 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BGNP21810 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BGNP21810 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BGNP21810 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BGNP21810 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BGNP21810 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BGNP21810 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BGNP21810 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BGNP21810 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BGNP21810 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BGNP21810 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BGNP21810 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BGNP21810 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BGNP21810 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BGNP21810 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BGNP21810 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BGNP21810 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BGNP21810 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BGNP21810 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BGNP21810 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BGNP21810 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BGNP21810 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BGNP21810 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BGNP21810 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BGNP21810 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BGNP21810 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BGNP21810 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BGNP21810 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BGNP21810 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BGNP21810 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BGNP21810 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BGNP21810 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BGNP21810 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BGNP21810 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BGNP21810 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BGNP21810 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BGNP21810 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BGNP21810 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BGNP21810 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BGNP21810 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BGNP21810 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BGNP21810 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BGNP21810 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BGNP21810 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BGNP21810 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BGNP21810 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BGNP21810 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BGNP21810 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BGNP21810 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BGNP21810 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BGNP21810 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BGNP21810 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BGNP21810 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BGNP21810 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BGNP21810 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BGNP21810 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BGNP21810 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BGNP21810 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BGNP21810 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BGNP21810 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BGNP21810 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BGNP21810 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BGNP21810 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BGNP21810 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BGNP21810 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BGNP21810 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BGNP21810 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BGNP21810 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BGNP21810 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BGNP21810 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BGNP21810 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
BGNP21810 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BGNP21810 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BGNP21810 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BGNP21810 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BGNP21810 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BGNP21810 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BGNP21810 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BGNP21810 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BGNP21810 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BGNP21810 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BGNP21810 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BGNP21810 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BGNP21810 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BGNP21810 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BGNP21810 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BGNP21810 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BGNP21810 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BGNP21810 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BGNP21810 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BGNP21810 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BGNP21810 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BGNP21810 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BGNP21810 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BGNP21810 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BGNP21810 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BGNP21810 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms