Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms