Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms