Protein–RNA interactions for Protein: P0C2S0

CTXN2, Cortexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN2P0C2S0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTXN2P0C2S0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CTXN2P0C2S0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTXN2P0C2S0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTXN2P0C2S0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTXN2P0C2S0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTXN2P0C2S0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTXN2P0C2S0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTXN2P0C2S0 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTXN2P0C2S0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTXN2P0C2S0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTXN2P0C2S0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTXN2P0C2S0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms