Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATCO43716 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATCO43716 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATCO43716 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATCO43716 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATCO43716 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATCO43716 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATCO43716 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATCO43716 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATCO43716 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATCO43716 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATCO43716 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATCO43716 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATCO43716 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATCO43716 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATCO43716 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATCO43716 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATCO43716 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GATCO43716 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATCO43716 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATCO43716 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GATCO43716 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GATCO43716 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GATCO43716 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GATCO43716 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATCO43716 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATCO43716 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATCO43716 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATCO43716 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATCO43716 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATCO43716 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATCO43716 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATCO43716 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GATCO43716 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GATCO43716 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GATCO43716 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GATCO43716 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GATCO43716 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GATCO43716 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GATCO43716 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GATCO43716 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GATCO43716 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GATCO43716 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GATCO43716 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GATCO43716 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GATCO43716 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GATCO43716 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GATCO43716 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATCO43716 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATCO43716 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATCO43716 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATCO43716 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATCO43716 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATCO43716 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATCO43716 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATCO43716 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATCO43716 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATCO43716 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATCO43716 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATCO43716 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATCO43716 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATCO43716 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATCO43716 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATCO43716 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATCO43716 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATCO43716 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATCO43716 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATCO43716 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATCO43716 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATCO43716 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATCO43716 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATCO43716 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATCO43716 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATCO43716 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATCO43716 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATCO43716 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATCO43716 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATCO43716 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATCO43716 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATCO43716 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATCO43716 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATCO43716 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATCO43716 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATCO43716 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATCO43716 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATCO43716 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATCO43716 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATCO43716 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATCO43716 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATCO43716 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATCO43716 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATCO43716 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATCO43716 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATCO43716 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATCO43716 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATCO43716 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATCO43716 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATCO43716 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATCO43716 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GATCO43716 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms