Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOCS1O15524 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms