Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F3O00716 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F3O00716 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F3O00716 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F3O00716 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
E2F3O00716 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
E2F3O00716 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
E2F3O00716 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
E2F3O00716 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F3O00716 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F3O00716 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F3O00716 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F3O00716 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F3O00716 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F3O00716 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F3O00716 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F3O00716 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F3O00716 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F3O00716 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F3O00716 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F3O00716 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F3O00716 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F3O00716 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F3O00716 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F3O00716 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F3O00716 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F3O00716 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F3O00716 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F3O00716 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F3O00716 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F3O00716 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
E2F3O00716 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F3O00716 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F3O00716 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
E2F3O00716 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F3O00716 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F3O00716 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
E2F3O00716 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
E2F3O00716 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
E2F3O00716 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F3O00716 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F3O00716 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
E2F3O00716 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
E2F3O00716 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F3O00716 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F3O00716 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F3O00716 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F3O00716 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
E2F3O00716 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
E2F3O00716 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F3O00716 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
E2F3O00716 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F3O00716 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F3O00716 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F3O00716 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F3O00716 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F3O00716 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F3O00716 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F3O00716 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F3O00716 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F3O00716 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F3O00716 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F3O00716 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F3O00716 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F3O00716 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F3O00716 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F3O00716 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F3O00716 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F3O00716 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F3O00716 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F3O00716 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F3O00716 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F3O00716 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F3O00716 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F3O00716 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F3O00716 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F3O00716 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F3O00716 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F3O00716 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F3O00716 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F3O00716 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F3O00716 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F3O00716 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F3O00716 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F3O00716 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F3O00716 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F3O00716 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F3O00716 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F3O00716 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F3O00716 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F3O00716 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F3O00716 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F3O00716 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F3O00716 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F3O00716 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F3O00716 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F3O00716 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F3O00716 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F3O00716 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F3O00716 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms