Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E9PBE3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E9PBE3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E9PBE3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E9PBE3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E9PBE3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E9PBE3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E9PBE3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E9PBE3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E9PBE3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E9PBE3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
E9PBE3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E9PBE3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E9PBE3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E9PBE3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E9PBE3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E9PBE3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E9PBE3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E9PBE3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E9PBE3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E9PBE3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E9PBE3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E9PBE3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E9PBE3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E9PBE3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E9PBE3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E9PBE3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E9PBE3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E9PBE3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E9PBE3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
E9PBE3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E9PBE3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E9PBE3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E9PBE3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E9PBE3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E9PBE3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E9PBE3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E9PBE3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E9PBE3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E9PBE3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E9PBE3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E9PBE3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E9PBE3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E9PBE3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E9PBE3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E9PBE3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E9PBE3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E9PBE3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E9PBE3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E9PBE3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E9PBE3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E9PBE3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E9PBE3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E9PBE3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E9PBE3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E9PBE3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
E9PBE3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
E9PBE3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
E9PBE3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
E9PBE3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
E9PBE3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
E9PBE3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E9PBE3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E9PBE3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E9PBE3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E9PBE3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E9PBE3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E9PBE3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E9PBE3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E9PBE3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E9PBE3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E9PBE3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E9PBE3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E9PBE3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E9PBE3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
E9PBE3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
E9PBE3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E9PBE3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E9PBE3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E9PBE3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E9PBE3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E9PBE3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E9PBE3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E9PBE3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E9PBE3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E9PBE3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E9PBE3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E9PBE3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E9PBE3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E9PBE3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E9PBE3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E9PBE3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E9PBE3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E9PBE3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
E9PBE3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E9PBE3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E9PBE3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E9PBE3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E9PBE3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
E9PBE3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms