Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ87

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQ87 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
U3KQ87 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
U3KQ87 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
U3KQ87 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
U3KQ87 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
U3KQ87 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
U3KQ87 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
U3KQ87 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
U3KQ87 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
U3KQ87 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
U3KQ87 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
U3KQ87 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
U3KQ87 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
U3KQ87 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
U3KQ87 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
U3KQ87 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
U3KQ87 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
U3KQ87 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
U3KQ87 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
U3KQ87 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
U3KQ87 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
U3KQ87 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
U3KQ87 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
U3KQ87 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
U3KQ87 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
U3KQ87 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
U3KQ87 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
U3KQ87 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
U3KQ87 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
U3KQ87 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
U3KQ87 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
U3KQ87 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
U3KQ87 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
U3KQ87 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
U3KQ87 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
U3KQ87 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
U3KQ87 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
U3KQ87 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
U3KQ87 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
U3KQ87 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
U3KQ87 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
U3KQ87 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
U3KQ87 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
U3KQ87 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
U3KQ87 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
U3KQ87 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
U3KQ87 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
U3KQ87 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
U3KQ87 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
U3KQ87 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
U3KQ87 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
U3KQ87 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
U3KQ87 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U3KQ87 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
U3KQ87 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
U3KQ87 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
U3KQ87 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
U3KQ87 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
U3KQ87 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
U3KQ87 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
U3KQ87 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
U3KQ87 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U3KQ87 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U3KQ87 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U3KQ87 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
U3KQ87 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
U3KQ87 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
U3KQ87 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
U3KQ87 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
U3KQ87 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
U3KQ87 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
U3KQ87 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
U3KQ87 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
U3KQ87 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
U3KQ87 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
U3KQ87 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
U3KQ87 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
U3KQ87 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
U3KQ87 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
U3KQ87 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
U3KQ87 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
U3KQ87 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
U3KQ87 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
U3KQ87 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
U3KQ87 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
U3KQ87 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
U3KQ87 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
U3KQ87 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
U3KQ87 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
U3KQ87 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
U3KQ87 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
U3KQ87 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
U3KQ87 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
U3KQ87 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
U3KQ87 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
U3KQ87 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
U3KQ87 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
U3KQ87 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
U3KQ87 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
U3KQ87 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms