Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N9

USH1C, Harmonin, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USH1CQ9Y6N9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USH1CQ9Y6N9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USH1CQ9Y6N9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USH1CQ9Y6N9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USH1CQ9Y6N9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USH1CQ9Y6N9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USH1CQ9Y6N9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USH1CQ9Y6N9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USH1CQ9Y6N9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USH1CQ9Y6N9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USH1CQ9Y6N9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USH1CQ9Y6N9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USH1CQ9Y6N9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USH1CQ9Y6N9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USH1CQ9Y6N9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USH1CQ9Y6N9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USH1CQ9Y6N9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USH1CQ9Y6N9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USH1CQ9Y6N9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USH1CQ9Y6N9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USH1CQ9Y6N9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USH1CQ9Y6N9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USH1CQ9Y6N9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USH1CQ9Y6N9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USH1CQ9Y6N9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USH1CQ9Y6N9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USH1CQ9Y6N9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USH1CQ9Y6N9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USH1CQ9Y6N9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USH1CQ9Y6N9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USH1CQ9Y6N9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
USH1CQ9Y6N9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USH1CQ9Y6N9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USH1CQ9Y6N9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USH1CQ9Y6N9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USH1CQ9Y6N9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USH1CQ9Y6N9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USH1CQ9Y6N9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USH1CQ9Y6N9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
USH1CQ9Y6N9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USH1CQ9Y6N9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USH1CQ9Y6N9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USH1CQ9Y6N9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USH1CQ9Y6N9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USH1CQ9Y6N9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USH1CQ9Y6N9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
USH1CQ9Y6N9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USH1CQ9Y6N9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USH1CQ9Y6N9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USH1CQ9Y6N9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USH1CQ9Y6N9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USH1CQ9Y6N9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USH1CQ9Y6N9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USH1CQ9Y6N9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USH1CQ9Y6N9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USH1CQ9Y6N9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USH1CQ9Y6N9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USH1CQ9Y6N9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USH1CQ9Y6N9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USH1CQ9Y6N9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USH1CQ9Y6N9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USH1CQ9Y6N9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USH1CQ9Y6N9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USH1CQ9Y6N9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
USH1CQ9Y6N9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USH1CQ9Y6N9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USH1CQ9Y6N9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USH1CQ9Y6N9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USH1CQ9Y6N9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USH1CQ9Y6N9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USH1CQ9Y6N9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USH1CQ9Y6N9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USH1CQ9Y6N9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USH1CQ9Y6N9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USH1CQ9Y6N9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USH1CQ9Y6N9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USH1CQ9Y6N9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USH1CQ9Y6N9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USH1CQ9Y6N9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USH1CQ9Y6N9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USH1CQ9Y6N9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USH1CQ9Y6N9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USH1CQ9Y6N9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USH1CQ9Y6N9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USH1CQ9Y6N9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USH1CQ9Y6N9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USH1CQ9Y6N9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USH1CQ9Y6N9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USH1CQ9Y6N9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
USH1CQ9Y6N9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USH1CQ9Y6N9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USH1CQ9Y6N9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USH1CQ9Y6N9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USH1CQ9Y6N9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USH1CQ9Y6N9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USH1CQ9Y6N9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USH1CQ9Y6N9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USH1CQ9Y6N9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USH1CQ9Y6N9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USH1CQ9Y6N9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms