Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCDHB2Q9Y5E7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCDHB2Q9Y5E7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCDHB2Q9Y5E7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCDHB2Q9Y5E7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCDHB2Q9Y5E7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCDHB2Q9Y5E7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCDHB2Q9Y5E7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCDHB2Q9Y5E7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCDHB2Q9Y5E7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCDHB2Q9Y5E7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCDHB2Q9Y5E7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PCDHB2Q9Y5E7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PCDHB2Q9Y5E7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PCDHB2Q9Y5E7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PCDHB2Q9Y5E7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCDHB2Q9Y5E7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCDHB2Q9Y5E7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCDHB2Q9Y5E7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCDHB2Q9Y5E7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCDHB2Q9Y5E7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCDHB2Q9Y5E7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCDHB2Q9Y5E7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCDHB2Q9Y5E7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PCDHB2Q9Y5E7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PCDHB2Q9Y5E7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PCDHB2Q9Y5E7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PCDHB2Q9Y5E7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PCDHB2Q9Y5E7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PCDHB2Q9Y5E7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PCDHB2Q9Y5E7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PCDHB2Q9Y5E7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PCDHB2Q9Y5E7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PCDHB2Q9Y5E7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PCDHB2Q9Y5E7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCDHB2Q9Y5E7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCDHB2Q9Y5E7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCDHB2Q9Y5E7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
PCDHB2Q9Y5E7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCDHB2Q9Y5E7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCDHB2Q9Y5E7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCDHB2Q9Y5E7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCDHB2Q9Y5E7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCDHB2Q9Y5E7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PCDHB2Q9Y5E7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCDHB2Q9Y5E7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCDHB2Q9Y5E7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHB2Q9Y5E7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHB2Q9Y5E7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHB2Q9Y5E7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHB2Q9Y5E7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHB2Q9Y5E7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHB2Q9Y5E7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHB2Q9Y5E7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHB2Q9Y5E7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHB2Q9Y5E7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHB2Q9Y5E7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHB2Q9Y5E7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHB2Q9Y5E7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHB2Q9Y5E7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCDHB2Q9Y5E7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCDHB2Q9Y5E7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCDHB2Q9Y5E7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHB2Q9Y5E7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHB2Q9Y5E7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHB2Q9Y5E7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHB2Q9Y5E7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHB2Q9Y5E7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHB2Q9Y5E7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHB2Q9Y5E7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHB2Q9Y5E7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHB2Q9Y5E7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHB2Q9Y5E7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHB2Q9Y5E7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHB2Q9Y5E7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHB2Q9Y5E7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHB2Q9Y5E7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHB2Q9Y5E7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHB2Q9Y5E7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHB2Q9Y5E7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCDHB2Q9Y5E7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCDHB2Q9Y5E7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCDHB2Q9Y5E7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCDHB2Q9Y5E7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCDHB2Q9Y5E7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHB2Q9Y5E7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHB2Q9Y5E7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHB2Q9Y5E7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHB2Q9Y5E7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHB2Q9Y5E7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHB2Q9Y5E7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHB2Q9Y5E7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHB2Q9Y5E7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHB2Q9Y5E7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHB2Q9Y5E7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHB2Q9Y5E7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHB2Q9Y5E7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms