Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4R7

TTLL3, Tubulin monoglycylase TTLL3, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3Q9Y4R7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTLL3Q9Y4R7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTLL3Q9Y4R7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTLL3Q9Y4R7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TTLL3Q9Y4R7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
TTLL3Q9Y4R7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TTLL3Q9Y4R7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TTLL3Q9Y4R7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TTLL3Q9Y4R7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTLL3Q9Y4R7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTLL3Q9Y4R7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTLL3Q9Y4R7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTLL3Q9Y4R7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTLL3Q9Y4R7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTLL3Q9Y4R7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTLL3Q9Y4R7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTLL3Q9Y4R7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TTLL3Q9Y4R7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TTLL3Q9Y4R7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTLL3Q9Y4R7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTLL3Q9Y4R7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTLL3Q9Y4R7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTLL3Q9Y4R7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTLL3Q9Y4R7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTLL3Q9Y4R7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTLL3Q9Y4R7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTLL3Q9Y4R7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTLL3Q9Y4R7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTLL3Q9Y4R7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTLL3Q9Y4R7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTLL3Q9Y4R7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTLL3Q9Y4R7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTLL3Q9Y4R7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTLL3Q9Y4R7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTLL3Q9Y4R7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTLL3Q9Y4R7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTLL3Q9Y4R7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTLL3Q9Y4R7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTLL3Q9Y4R7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTLL3Q9Y4R7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTLL3Q9Y4R7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TTLL3Q9Y4R7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TTLL3Q9Y4R7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TTLL3Q9Y4R7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TTLL3Q9Y4R7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TTLL3Q9Y4R7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTLL3Q9Y4R7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TTLL3Q9Y4R7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTLL3Q9Y4R7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TTLL3Q9Y4R7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TTLL3Q9Y4R7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TTLL3Q9Y4R7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TTLL3Q9Y4R7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTLL3Q9Y4R7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TTLL3Q9Y4R7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTLL3Q9Y4R7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTLL3Q9Y4R7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TTLL3Q9Y4R7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TTLL3Q9Y4R7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTLL3Q9Y4R7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTLL3Q9Y4R7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTLL3Q9Y4R7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTLL3Q9Y4R7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TTLL3Q9Y4R7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TTLL3Q9Y4R7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TTLL3Q9Y4R7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TTLL3Q9Y4R7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTLL3Q9Y4R7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTLL3Q9Y4R7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTLL3Q9Y4R7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTLL3Q9Y4R7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTLL3Q9Y4R7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTLL3Q9Y4R7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TTLL3Q9Y4R7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTLL3Q9Y4R7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTLL3Q9Y4R7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTLL3Q9Y4R7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTLL3Q9Y4R7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTLL3Q9Y4R7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTLL3Q9Y4R7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TTLL3Q9Y4R7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTLL3Q9Y4R7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTLL3Q9Y4R7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTLL3Q9Y4R7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TTLL3Q9Y4R7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTLL3Q9Y4R7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTLL3Q9Y4R7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTLL3Q9Y4R7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TTLL3Q9Y4R7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTLL3Q9Y4R7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTLL3Q9Y4R7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTLL3Q9Y4R7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTLL3Q9Y4R7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTLL3Q9Y4R7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTLL3Q9Y4R7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TTLL3Q9Y4R7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTLL3Q9Y4R7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTLL3Q9Y4R7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTLL3Q9Y4R7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTLL3Q9Y4R7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms