Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P9

SPEF1, Sperm flagellar protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF1Q9Y4P9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SPEF1Q9Y4P9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPEF1Q9Y4P9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPEF1Q9Y4P9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPEF1Q9Y4P9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPEF1Q9Y4P9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPEF1Q9Y4P9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPEF1Q9Y4P9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPEF1Q9Y4P9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPEF1Q9Y4P9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPEF1Q9Y4P9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPEF1Q9Y4P9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SPEF1Q9Y4P9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPEF1Q9Y4P9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPEF1Q9Y4P9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPEF1Q9Y4P9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPEF1Q9Y4P9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPEF1Q9Y4P9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPEF1Q9Y4P9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPEF1Q9Y4P9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPEF1Q9Y4P9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPEF1Q9Y4P9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPEF1Q9Y4P9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPEF1Q9Y4P9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPEF1Q9Y4P9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPEF1Q9Y4P9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPEF1Q9Y4P9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPEF1Q9Y4P9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPEF1Q9Y4P9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPEF1Q9Y4P9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPEF1Q9Y4P9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPEF1Q9Y4P9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPEF1Q9Y4P9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPEF1Q9Y4P9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPEF1Q9Y4P9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPEF1Q9Y4P9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SPEF1Q9Y4P9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPEF1Q9Y4P9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPEF1Q9Y4P9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPEF1Q9Y4P9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPEF1Q9Y4P9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPEF1Q9Y4P9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPEF1Q9Y4P9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPEF1Q9Y4P9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPEF1Q9Y4P9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPEF1Q9Y4P9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPEF1Q9Y4P9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPEF1Q9Y4P9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPEF1Q9Y4P9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPEF1Q9Y4P9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPEF1Q9Y4P9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPEF1Q9Y4P9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPEF1Q9Y4P9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPEF1Q9Y4P9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPEF1Q9Y4P9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPEF1Q9Y4P9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPEF1Q9Y4P9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPEF1Q9Y4P9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPEF1Q9Y4P9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPEF1Q9Y4P9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPEF1Q9Y4P9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SPEF1Q9Y4P9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPEF1Q9Y4P9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPEF1Q9Y4P9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPEF1Q9Y4P9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPEF1Q9Y4P9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPEF1Q9Y4P9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPEF1Q9Y4P9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SPEF1Q9Y4P9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPEF1Q9Y4P9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPEF1Q9Y4P9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPEF1Q9Y4P9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPEF1Q9Y4P9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPEF1Q9Y4P9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPEF1Q9Y4P9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPEF1Q9Y4P9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPEF1Q9Y4P9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPEF1Q9Y4P9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPEF1Q9Y4P9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPEF1Q9Y4P9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPEF1Q9Y4P9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPEF1Q9Y4P9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPEF1Q9Y4P9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPEF1Q9Y4P9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SPEF1Q9Y4P9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPEF1Q9Y4P9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPEF1Q9Y4P9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPEF1Q9Y4P9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPEF1Q9Y4P9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPEF1Q9Y4P9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPEF1Q9Y4P9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPEF1Q9Y4P9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPEF1Q9Y4P9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPEF1Q9Y4P9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPEF1Q9Y4P9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPEF1Q9Y4P9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPEF1Q9Y4P9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPEF1Q9Y4P9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPEF1Q9Y4P9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPEF1Q9Y4P9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms