Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y9

KLF13, Krueppel-like factor 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF13Q9Y2Y9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLF13Q9Y2Y9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLF13Q9Y2Y9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KLF13Q9Y2Y9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLF13Q9Y2Y9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLF13Q9Y2Y9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLF13Q9Y2Y9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLF13Q9Y2Y9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLF13Q9Y2Y9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KLF13Q9Y2Y9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLF13Q9Y2Y9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLF13Q9Y2Y9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KLF13Q9Y2Y9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLF13Q9Y2Y9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLF13Q9Y2Y9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLF13Q9Y2Y9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLF13Q9Y2Y9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLF13Q9Y2Y9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KLF13Q9Y2Y9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLF13Q9Y2Y9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLF13Q9Y2Y9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLF13Q9Y2Y9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLF13Q9Y2Y9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLF13Q9Y2Y9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLF13Q9Y2Y9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLF13Q9Y2Y9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLF13Q9Y2Y9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLF13Q9Y2Y9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLF13Q9Y2Y9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLF13Q9Y2Y9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLF13Q9Y2Y9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
KLF13Q9Y2Y9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLF13Q9Y2Y9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLF13Q9Y2Y9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLF13Q9Y2Y9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLF13Q9Y2Y9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLF13Q9Y2Y9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLF13Q9Y2Y9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLF13Q9Y2Y9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLF13Q9Y2Y9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLF13Q9Y2Y9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLF13Q9Y2Y9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLF13Q9Y2Y9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLF13Q9Y2Y9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLF13Q9Y2Y9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLF13Q9Y2Y9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLF13Q9Y2Y9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLF13Q9Y2Y9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLF13Q9Y2Y9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLF13Q9Y2Y9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLF13Q9Y2Y9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLF13Q9Y2Y9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLF13Q9Y2Y9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLF13Q9Y2Y9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLF13Q9Y2Y9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLF13Q9Y2Y9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLF13Q9Y2Y9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLF13Q9Y2Y9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLF13Q9Y2Y9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLF13Q9Y2Y9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KLF13Q9Y2Y9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLF13Q9Y2Y9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLF13Q9Y2Y9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLF13Q9Y2Y9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLF13Q9Y2Y9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLF13Q9Y2Y9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLF13Q9Y2Y9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLF13Q9Y2Y9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLF13Q9Y2Y9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLF13Q9Y2Y9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLF13Q9Y2Y9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLF13Q9Y2Y9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLF13Q9Y2Y9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLF13Q9Y2Y9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLF13Q9Y2Y9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLF13Q9Y2Y9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLF13Q9Y2Y9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLF13Q9Y2Y9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLF13Q9Y2Y9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLF13Q9Y2Y9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLF13Q9Y2Y9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLF13Q9Y2Y9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLF13Q9Y2Y9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLF13Q9Y2Y9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLF13Q9Y2Y9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLF13Q9Y2Y9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLF13Q9Y2Y9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLF13Q9Y2Y9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLF13Q9Y2Y9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLF13Q9Y2Y9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLF13Q9Y2Y9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLF13Q9Y2Y9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLF13Q9Y2Y9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLF13Q9Y2Y9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLF13Q9Y2Y9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLF13Q9Y2Y9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KLF13Q9Y2Y9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLF13Q9Y2Y9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLF13Q9Y2Y9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KLF13Q9Y2Y9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms