Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ90

SPG7, Paraplegin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG7Q9UQ90 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SPG7Q9UQ90 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SPG7Q9UQ90 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SPG7Q9UQ90 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SPG7Q9UQ90 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SPG7Q9UQ90 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SPG7Q9UQ90 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SPG7Q9UQ90 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
SPG7Q9UQ90 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SPG7Q9UQ90 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SPG7Q9UQ90 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SPG7Q9UQ90 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SPG7Q9UQ90 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SPG7Q9UQ90 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
SPG7Q9UQ90 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SPG7Q9UQ90 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
SPG7Q9UQ90 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
SPG7Q9UQ90 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
SPG7Q9UQ90 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SPG7Q9UQ90 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SPG7Q9UQ90 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SPG7Q9UQ90 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SPG7Q9UQ90 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SPG7Q9UQ90 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SPG7Q9UQ90 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SPG7Q9UQ90 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SPG7Q9UQ90 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SPG7Q9UQ90 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SPG7Q9UQ90 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
SPG7Q9UQ90 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SPG7Q9UQ90 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SPG7Q9UQ90 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SPG7Q9UQ90 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SPG7Q9UQ90 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SPG7Q9UQ90 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SPG7Q9UQ90 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SPG7Q9UQ90 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SPG7Q9UQ90 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SPG7Q9UQ90 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SPG7Q9UQ90 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
SPG7Q9UQ90 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SPG7Q9UQ90 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SPG7Q9UQ90 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SPG7Q9UQ90 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SPG7Q9UQ90 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SPG7Q9UQ90 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SPG7Q9UQ90 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SPG7Q9UQ90 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SPG7Q9UQ90 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SPG7Q9UQ90 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SPG7Q9UQ90 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SPG7Q9UQ90 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
SPG7Q9UQ90 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SPG7Q9UQ90 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SPG7Q9UQ90 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SPG7Q9UQ90 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
SPG7Q9UQ90 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
SPG7Q9UQ90 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
SPG7Q9UQ90 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SPG7Q9UQ90 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SPG7Q9UQ90 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
SPG7Q9UQ90 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SPG7Q9UQ90 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
SPG7Q9UQ90 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SPG7Q9UQ90 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
SPG7Q9UQ90 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SPG7Q9UQ90 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
SPG7Q9UQ90 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC33.79■■■■□ 3
SPG7Q9UQ90 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
SPG7Q9UQ90 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SPG7Q9UQ90 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SPG7Q9UQ90 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SPG7Q9UQ90 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SPG7Q9UQ90 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SPG7Q9UQ90 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SPG7Q9UQ90 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
SPG7Q9UQ90 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SPG7Q9UQ90 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SPG7Q9UQ90 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
SPG7Q9UQ90 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SPG7Q9UQ90 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SPG7Q9UQ90 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SPG7Q9UQ90 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SPG7Q9UQ90 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SPG7Q9UQ90 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SPG7Q9UQ90 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SPG7Q9UQ90 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SPG7Q9UQ90 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SPG7Q9UQ90 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SPG7Q9UQ90 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
SPG7Q9UQ90 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SPG7Q9UQ90 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SPG7Q9UQ90 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SPG7Q9UQ90 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SPG7Q9UQ90 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SPG7Q9UQ90 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
SPG7Q9UQ90 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SPG7Q9UQ90 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SPG7Q9UQ90 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SPG7Q9UQ90 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
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