Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ8

DOLK, Dolichol kinase, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DOLKQ9UPQ8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DOLKQ9UPQ8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DOLKQ9UPQ8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DOLKQ9UPQ8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DOLKQ9UPQ8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DOLKQ9UPQ8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DOLKQ9UPQ8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DOLKQ9UPQ8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DOLKQ9UPQ8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DOLKQ9UPQ8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DOLKQ9UPQ8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DOLKQ9UPQ8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DOLKQ9UPQ8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DOLKQ9UPQ8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DOLKQ9UPQ8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DOLKQ9UPQ8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
DOLKQ9UPQ8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DOLKQ9UPQ8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DOLKQ9UPQ8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DOLKQ9UPQ8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DOLKQ9UPQ8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DOLKQ9UPQ8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DOLKQ9UPQ8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DOLKQ9UPQ8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DOLKQ9UPQ8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DOLKQ9UPQ8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DOLKQ9UPQ8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DOLKQ9UPQ8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DOLKQ9UPQ8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DOLKQ9UPQ8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DOLKQ9UPQ8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DOLKQ9UPQ8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DOLKQ9UPQ8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DOLKQ9UPQ8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DOLKQ9UPQ8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DOLKQ9UPQ8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DOLKQ9UPQ8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DOLKQ9UPQ8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DOLKQ9UPQ8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DOLKQ9UPQ8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DOLKQ9UPQ8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DOLKQ9UPQ8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DOLKQ9UPQ8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DOLKQ9UPQ8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DOLKQ9UPQ8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DOLKQ9UPQ8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DOLKQ9UPQ8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DOLKQ9UPQ8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DOLKQ9UPQ8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DOLKQ9UPQ8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DOLKQ9UPQ8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DOLKQ9UPQ8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DOLKQ9UPQ8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DOLKQ9UPQ8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DOLKQ9UPQ8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DOLKQ9UPQ8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DOLKQ9UPQ8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DOLKQ9UPQ8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DOLKQ9UPQ8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DOLKQ9UPQ8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DOLKQ9UPQ8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DOLKQ9UPQ8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DOLKQ9UPQ8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DOLKQ9UPQ8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DOLKQ9UPQ8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DOLKQ9UPQ8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DOLKQ9UPQ8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DOLKQ9UPQ8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DOLKQ9UPQ8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DOLKQ9UPQ8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DOLKQ9UPQ8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DOLKQ9UPQ8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DOLKQ9UPQ8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DOLKQ9UPQ8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DOLKQ9UPQ8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DOLKQ9UPQ8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DOLKQ9UPQ8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DOLKQ9UPQ8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DOLKQ9UPQ8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DOLKQ9UPQ8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DOLKQ9UPQ8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DOLKQ9UPQ8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DOLKQ9UPQ8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
DOLKQ9UPQ8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DOLKQ9UPQ8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DOLKQ9UPQ8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DOLKQ9UPQ8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DOLKQ9UPQ8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DOLKQ9UPQ8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DOLKQ9UPQ8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DOLKQ9UPQ8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DOLKQ9UPQ8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DOLKQ9UPQ8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DOLKQ9UPQ8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DOLKQ9UPQ8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DOLKQ9UPQ8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DOLKQ9UPQ8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DOLKQ9UPQ8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DOLKQ9UPQ8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DOLKQ9UPQ8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.7 ms