Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNL2

SSR3, Translocon-associated protein subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR3Q9UNL2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSR3Q9UNL2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSR3Q9UNL2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSR3Q9UNL2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSR3Q9UNL2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSR3Q9UNL2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SSR3Q9UNL2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSR3Q9UNL2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSR3Q9UNL2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSR3Q9UNL2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSR3Q9UNL2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSR3Q9UNL2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSR3Q9UNL2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSR3Q9UNL2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSR3Q9UNL2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSR3Q9UNL2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSR3Q9UNL2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSR3Q9UNL2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSR3Q9UNL2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSR3Q9UNL2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSR3Q9UNL2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSR3Q9UNL2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SSR3Q9UNL2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSR3Q9UNL2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SSR3Q9UNL2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSR3Q9UNL2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSR3Q9UNL2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSR3Q9UNL2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSR3Q9UNL2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSR3Q9UNL2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSR3Q9UNL2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSR3Q9UNL2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSR3Q9UNL2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSR3Q9UNL2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SSR3Q9UNL2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSR3Q9UNL2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSR3Q9UNL2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSR3Q9UNL2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SSR3Q9UNL2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSR3Q9UNL2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSR3Q9UNL2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSR3Q9UNL2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSR3Q9UNL2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSR3Q9UNL2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSR3Q9UNL2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSR3Q9UNL2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSR3Q9UNL2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSR3Q9UNL2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSR3Q9UNL2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSR3Q9UNL2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSR3Q9UNL2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSR3Q9UNL2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSR3Q9UNL2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSR3Q9UNL2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSR3Q9UNL2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSR3Q9UNL2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSR3Q9UNL2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSR3Q9UNL2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSR3Q9UNL2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSR3Q9UNL2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSR3Q9UNL2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSR3Q9UNL2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SSR3Q9UNL2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SSR3Q9UNL2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SSR3Q9UNL2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSR3Q9UNL2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSR3Q9UNL2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SSR3Q9UNL2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSR3Q9UNL2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSR3Q9UNL2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSR3Q9UNL2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SSR3Q9UNL2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSR3Q9UNL2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSR3Q9UNL2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSR3Q9UNL2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSR3Q9UNL2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSR3Q9UNL2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSR3Q9UNL2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSR3Q9UNL2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SSR3Q9UNL2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSR3Q9UNL2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSR3Q9UNL2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSR3Q9UNL2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSR3Q9UNL2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSR3Q9UNL2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSR3Q9UNL2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSR3Q9UNL2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSR3Q9UNL2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSR3Q9UNL2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSR3Q9UNL2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSR3Q9UNL2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSR3Q9UNL2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSR3Q9UNL2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSR3Q9UNL2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSR3Q9UNL2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSR3Q9UNL2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSR3Q9UNL2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSR3Q9UNL2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSR3Q9UNL2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSR3Q9UNL2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms