Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULZ9

MMP17, Matrix metalloproteinase-17, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP17Q9ULZ9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP17Q9ULZ9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP17Q9ULZ9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MMP17Q9ULZ9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MMP17Q9ULZ9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MMP17Q9ULZ9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MMP17Q9ULZ9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MMP17Q9ULZ9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MMP17Q9ULZ9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MMP17Q9ULZ9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MMP17Q9ULZ9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MMP17Q9ULZ9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MMP17Q9ULZ9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MMP17Q9ULZ9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MMP17Q9ULZ9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MMP17Q9ULZ9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MMP17Q9ULZ9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MMP17Q9ULZ9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MMP17Q9ULZ9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MMP17Q9ULZ9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MMP17Q9ULZ9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MMP17Q9ULZ9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MMP17Q9ULZ9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MMP17Q9ULZ9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MMP17Q9ULZ9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
MMP17Q9ULZ9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MMP17Q9ULZ9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MMP17Q9ULZ9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MMP17Q9ULZ9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MMP17Q9ULZ9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP17Q9ULZ9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP17Q9ULZ9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP17Q9ULZ9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP17Q9ULZ9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP17Q9ULZ9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP17Q9ULZ9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP17Q9ULZ9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MMP17Q9ULZ9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MMP17Q9ULZ9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MMP17Q9ULZ9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MMP17Q9ULZ9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MMP17Q9ULZ9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
MMP17Q9ULZ9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MMP17Q9ULZ9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MMP17Q9ULZ9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MMP17Q9ULZ9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MMP17Q9ULZ9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MMP17Q9ULZ9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MMP17Q9ULZ9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MMP17Q9ULZ9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MMP17Q9ULZ9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MMP17Q9ULZ9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MMP17Q9ULZ9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MMP17Q9ULZ9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MMP17Q9ULZ9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MMP17Q9ULZ9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMP17Q9ULZ9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMP17Q9ULZ9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMP17Q9ULZ9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MMP17Q9ULZ9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MMP17Q9ULZ9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MMP17Q9ULZ9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MMP17Q9ULZ9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MMP17Q9ULZ9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MMP17Q9ULZ9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MMP17Q9ULZ9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MMP17Q9ULZ9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MMP17Q9ULZ9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MMP17Q9ULZ9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MMP17Q9ULZ9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MMP17Q9ULZ9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
MMP17Q9ULZ9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
MMP17Q9ULZ9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP17Q9ULZ9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP17Q9ULZ9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP17Q9ULZ9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP17Q9ULZ9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MMP17Q9ULZ9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MMP17Q9ULZ9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MMP17Q9ULZ9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MMP17Q9ULZ9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MMP17Q9ULZ9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MMP17Q9ULZ9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MMP17Q9ULZ9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MMP17Q9ULZ9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MMP17Q9ULZ9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MMP17Q9ULZ9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MMP17Q9ULZ9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MMP17Q9ULZ9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MMP17Q9ULZ9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MMP17Q9ULZ9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MMP17Q9ULZ9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MMP17Q9ULZ9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MMP17Q9ULZ9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MMP17Q9ULZ9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MMP17Q9ULZ9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MMP17Q9ULZ9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MMP17Q9ULZ9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MMP17Q9ULZ9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MMP17Q9ULZ9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms