Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FZD4Q9ULV1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FZD4Q9ULV1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FZD4Q9ULV1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FZD4Q9ULV1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FZD4Q9ULV1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FZD4Q9ULV1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FZD4Q9ULV1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FZD4Q9ULV1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FZD4Q9ULV1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FZD4Q9ULV1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FZD4Q9ULV1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FZD4Q9ULV1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FZD4Q9ULV1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FZD4Q9ULV1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FZD4Q9ULV1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FZD4Q9ULV1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FZD4Q9ULV1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FZD4Q9ULV1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FZD4Q9ULV1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FZD4Q9ULV1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FZD4Q9ULV1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FZD4Q9ULV1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FZD4Q9ULV1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FZD4Q9ULV1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FZD4Q9ULV1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FZD4Q9ULV1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
FZD4Q9ULV1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FZD4Q9ULV1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FZD4Q9ULV1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FZD4Q9ULV1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FZD4Q9ULV1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FZD4Q9ULV1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FZD4Q9ULV1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FZD4Q9ULV1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FZD4Q9ULV1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FZD4Q9ULV1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
FZD4Q9ULV1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FZD4Q9ULV1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FZD4Q9ULV1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FZD4Q9ULV1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FZD4Q9ULV1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FZD4Q9ULV1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FZD4Q9ULV1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FZD4Q9ULV1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FZD4Q9ULV1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FZD4Q9ULV1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FZD4Q9ULV1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FZD4Q9ULV1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FZD4Q9ULV1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FZD4Q9ULV1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FZD4Q9ULV1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FZD4Q9ULV1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FZD4Q9ULV1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FZD4Q9ULV1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FZD4Q9ULV1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FZD4Q9ULV1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FZD4Q9ULV1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FZD4Q9ULV1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FZD4Q9ULV1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FZD4Q9ULV1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FZD4Q9ULV1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FZD4Q9ULV1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FZD4Q9ULV1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FZD4Q9ULV1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FZD4Q9ULV1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FZD4Q9ULV1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FZD4Q9ULV1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FZD4Q9ULV1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FZD4Q9ULV1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FZD4Q9ULV1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FZD4Q9ULV1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FZD4Q9ULV1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FZD4Q9ULV1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FZD4Q9ULV1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FZD4Q9ULV1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FZD4Q9ULV1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FZD4Q9ULV1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FZD4Q9ULV1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FZD4Q9ULV1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FZD4Q9ULV1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FZD4Q9ULV1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FZD4Q9ULV1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FZD4Q9ULV1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FZD4Q9ULV1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FZD4Q9ULV1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FZD4Q9ULV1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FZD4Q9ULV1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
FZD4Q9ULV1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FZD4Q9ULV1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FZD4Q9ULV1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
FZD4Q9ULV1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FZD4Q9ULV1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
FZD4Q9ULV1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FZD4Q9ULV1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FZD4Q9ULV1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FZD4Q9ULV1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FZD4Q9ULV1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FZD4Q9ULV1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FZD4Q9ULV1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms