Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULP0

NDRG4, Protein NDRG4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG4Q9ULP0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDRG4Q9ULP0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDRG4Q9ULP0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDRG4Q9ULP0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDRG4Q9ULP0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDRG4Q9ULP0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NDRG4Q9ULP0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDRG4Q9ULP0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDRG4Q9ULP0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDRG4Q9ULP0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDRG4Q9ULP0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDRG4Q9ULP0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDRG4Q9ULP0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDRG4Q9ULP0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDRG4Q9ULP0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDRG4Q9ULP0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDRG4Q9ULP0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDRG4Q9ULP0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDRG4Q9ULP0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDRG4Q9ULP0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDRG4Q9ULP0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDRG4Q9ULP0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDRG4Q9ULP0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDRG4Q9ULP0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDRG4Q9ULP0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDRG4Q9ULP0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NDRG4Q9ULP0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDRG4Q9ULP0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDRG4Q9ULP0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDRG4Q9ULP0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDRG4Q9ULP0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NDRG4Q9ULP0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
NDRG4Q9ULP0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDRG4Q9ULP0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDRG4Q9ULP0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDRG4Q9ULP0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDRG4Q9ULP0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDRG4Q9ULP0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDRG4Q9ULP0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDRG4Q9ULP0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDRG4Q9ULP0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDRG4Q9ULP0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDRG4Q9ULP0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDRG4Q9ULP0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NDRG4Q9ULP0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDRG4Q9ULP0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDRG4Q9ULP0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDRG4Q9ULP0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDRG4Q9ULP0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDRG4Q9ULP0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDRG4Q9ULP0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDRG4Q9ULP0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDRG4Q9ULP0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDRG4Q9ULP0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDRG4Q9ULP0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDRG4Q9ULP0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDRG4Q9ULP0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDRG4Q9ULP0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDRG4Q9ULP0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NDRG4Q9ULP0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDRG4Q9ULP0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDRG4Q9ULP0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDRG4Q9ULP0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDRG4Q9ULP0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDRG4Q9ULP0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDRG4Q9ULP0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDRG4Q9ULP0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDRG4Q9ULP0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDRG4Q9ULP0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NDRG4Q9ULP0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDRG4Q9ULP0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDRG4Q9ULP0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDRG4Q9ULP0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDRG4Q9ULP0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDRG4Q9ULP0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDRG4Q9ULP0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDRG4Q9ULP0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDRG4Q9ULP0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDRG4Q9ULP0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDRG4Q9ULP0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDRG4Q9ULP0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDRG4Q9ULP0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDRG4Q9ULP0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDRG4Q9ULP0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDRG4Q9ULP0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDRG4Q9ULP0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDRG4Q9ULP0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NDRG4Q9ULP0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDRG4Q9ULP0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDRG4Q9ULP0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDRG4Q9ULP0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDRG4Q9ULP0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDRG4Q9ULP0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDRG4Q9ULP0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NDRG4Q9ULP0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDRG4Q9ULP0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDRG4Q9ULP0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDRG4Q9ULP0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDRG4Q9ULP0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDRG4Q9ULP0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms