Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULH4

LRFN2, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN2Q9ULH4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRFN2Q9ULH4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRFN2Q9ULH4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRFN2Q9ULH4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRFN2Q9ULH4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRFN2Q9ULH4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRFN2Q9ULH4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRFN2Q9ULH4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRFN2Q9ULH4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRFN2Q9ULH4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRFN2Q9ULH4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LRFN2Q9ULH4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRFN2Q9ULH4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRFN2Q9ULH4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRFN2Q9ULH4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRFN2Q9ULH4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRFN2Q9ULH4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRFN2Q9ULH4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRFN2Q9ULH4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRFN2Q9ULH4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRFN2Q9ULH4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRFN2Q9ULH4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRFN2Q9ULH4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRFN2Q9ULH4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRFN2Q9ULH4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRFN2Q9ULH4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRFN2Q9ULH4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRFN2Q9ULH4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
LRFN2Q9ULH4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRFN2Q9ULH4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRFN2Q9ULH4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
LRFN2Q9ULH4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRFN2Q9ULH4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRFN2Q9ULH4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRFN2Q9ULH4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRFN2Q9ULH4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRFN2Q9ULH4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRFN2Q9ULH4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRFN2Q9ULH4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRFN2Q9ULH4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRFN2Q9ULH4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRFN2Q9ULH4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRFN2Q9ULH4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRFN2Q9ULH4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRFN2Q9ULH4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRFN2Q9ULH4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRFN2Q9ULH4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRFN2Q9ULH4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
LRFN2Q9ULH4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRFN2Q9ULH4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRFN2Q9ULH4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRFN2Q9ULH4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRFN2Q9ULH4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRFN2Q9ULH4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRFN2Q9ULH4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRFN2Q9ULH4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRFN2Q9ULH4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRFN2Q9ULH4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRFN2Q9ULH4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRFN2Q9ULH4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
LRFN2Q9ULH4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
LRFN2Q9ULH4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRFN2Q9ULH4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRFN2Q9ULH4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRFN2Q9ULH4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRFN2Q9ULH4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRFN2Q9ULH4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRFN2Q9ULH4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRFN2Q9ULH4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRFN2Q9ULH4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRFN2Q9ULH4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRFN2Q9ULH4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRFN2Q9ULH4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRFN2Q9ULH4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRFN2Q9ULH4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRFN2Q9ULH4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRFN2Q9ULH4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRFN2Q9ULH4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
LRFN2Q9ULH4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRFN2Q9ULH4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRFN2Q9ULH4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRFN2Q9ULH4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRFN2Q9ULH4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRFN2Q9ULH4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRFN2Q9ULH4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRFN2Q9ULH4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LRFN2Q9ULH4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRFN2Q9ULH4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LRFN2Q9ULH4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRFN2Q9ULH4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LRFN2Q9ULH4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRFN2Q9ULH4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRFN2Q9ULH4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRFN2Q9ULH4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRFN2Q9ULH4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRFN2Q9ULH4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRFN2Q9ULH4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRFN2Q9ULH4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRFN2Q9ULH4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRFN2Q9ULH4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms