Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC42EP3Q9UKI2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC42EP3Q9UKI2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC42EP3Q9UKI2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC42EP3Q9UKI2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC42EP3Q9UKI2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC42EP3Q9UKI2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC42EP3Q9UKI2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC42EP3Q9UKI2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDC42EP3Q9UKI2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDC42EP3Q9UKI2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CDC42EP3Q9UKI2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDC42EP3Q9UKI2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDC42EP3Q9UKI2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDC42EP3Q9UKI2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDC42EP3Q9UKI2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDC42EP3Q9UKI2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDC42EP3Q9UKI2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP3Q9UKI2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP3Q9UKI2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP3Q9UKI2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP3Q9UKI2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP3Q9UKI2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP3Q9UKI2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP3Q9UKI2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP3Q9UKI2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP3Q9UKI2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP3Q9UKI2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP3Q9UKI2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP3Q9UKI2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP3Q9UKI2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP3Q9UKI2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CDC42EP3Q9UKI2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDC42EP3Q9UKI2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CDC42EP3Q9UKI2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDC42EP3Q9UKI2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDC42EP3Q9UKI2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC42EP3Q9UKI2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC42EP3Q9UKI2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC42EP3Q9UKI2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC42EP3Q9UKI2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC42EP3Q9UKI2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC42EP3Q9UKI2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC42EP3Q9UKI2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC42EP3Q9UKI2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC42EP3Q9UKI2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC42EP3Q9UKI2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC42EP3Q9UKI2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC42EP3Q9UKI2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC42EP3Q9UKI2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC42EP3Q9UKI2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC42EP3Q9UKI2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC42EP3Q9UKI2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC42EP3Q9UKI2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDC42EP3Q9UKI2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDC42EP3Q9UKI2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDC42EP3Q9UKI2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDC42EP3Q9UKI2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CDC42EP3Q9UKI2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CDC42EP3Q9UKI2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDC42EP3Q9UKI2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDC42EP3Q9UKI2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDC42EP3Q9UKI2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDC42EP3Q9UKI2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDC42EP3Q9UKI2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDC42EP3Q9UKI2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CDC42EP3Q9UKI2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDC42EP3Q9UKI2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDC42EP3Q9UKI2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDC42EP3Q9UKI2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDC42EP3Q9UKI2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDC42EP3Q9UKI2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CDC42EP3Q9UKI2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDC42EP3Q9UKI2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDC42EP3Q9UKI2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDC42EP3Q9UKI2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDC42EP3Q9UKI2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDC42EP3Q9UKI2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDC42EP3Q9UKI2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDC42EP3Q9UKI2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDC42EP3Q9UKI2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDC42EP3Q9UKI2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDC42EP3Q9UKI2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDC42EP3Q9UKI2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDC42EP3Q9UKI2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDC42EP3Q9UKI2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDC42EP3Q9UKI2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDC42EP3Q9UKI2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC42EP3Q9UKI2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC42EP3Q9UKI2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC42EP3Q9UKI2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC42EP3Q9UKI2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC42EP3Q9UKI2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC42EP3Q9UKI2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC42EP3Q9UKI2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC42EP3Q9UKI2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms