Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJA5

TRMT6, tRNA (adenine(58)-N(1))-methyltransferase non-catalytic subunit TRM6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT6Q9UJA5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRMT6Q9UJA5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRMT6Q9UJA5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRMT6Q9UJA5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRMT6Q9UJA5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TRMT6Q9UJA5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRMT6Q9UJA5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRMT6Q9UJA5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRMT6Q9UJA5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRMT6Q9UJA5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRMT6Q9UJA5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRMT6Q9UJA5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRMT6Q9UJA5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRMT6Q9UJA5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRMT6Q9UJA5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRMT6Q9UJA5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRMT6Q9UJA5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRMT6Q9UJA5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRMT6Q9UJA5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRMT6Q9UJA5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRMT6Q9UJA5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRMT6Q9UJA5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRMT6Q9UJA5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRMT6Q9UJA5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRMT6Q9UJA5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRMT6Q9UJA5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRMT6Q9UJA5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRMT6Q9UJA5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRMT6Q9UJA5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRMT6Q9UJA5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRMT6Q9UJA5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRMT6Q9UJA5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRMT6Q9UJA5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRMT6Q9UJA5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRMT6Q9UJA5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRMT6Q9UJA5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRMT6Q9UJA5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TRMT6Q9UJA5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRMT6Q9UJA5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRMT6Q9UJA5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRMT6Q9UJA5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TRMT6Q9UJA5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRMT6Q9UJA5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRMT6Q9UJA5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRMT6Q9UJA5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRMT6Q9UJA5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRMT6Q9UJA5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRMT6Q9UJA5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRMT6Q9UJA5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRMT6Q9UJA5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRMT6Q9UJA5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRMT6Q9UJA5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRMT6Q9UJA5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRMT6Q9UJA5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRMT6Q9UJA5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRMT6Q9UJA5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRMT6Q9UJA5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRMT6Q9UJA5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRMT6Q9UJA5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRMT6Q9UJA5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRMT6Q9UJA5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRMT6Q9UJA5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRMT6Q9UJA5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRMT6Q9UJA5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRMT6Q9UJA5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRMT6Q9UJA5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRMT6Q9UJA5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRMT6Q9UJA5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRMT6Q9UJA5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRMT6Q9UJA5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRMT6Q9UJA5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRMT6Q9UJA5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRMT6Q9UJA5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRMT6Q9UJA5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRMT6Q9UJA5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRMT6Q9UJA5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TRMT6Q9UJA5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRMT6Q9UJA5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRMT6Q9UJA5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRMT6Q9UJA5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRMT6Q9UJA5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRMT6Q9UJA5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRMT6Q9UJA5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRMT6Q9UJA5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRMT6Q9UJA5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRMT6Q9UJA5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRMT6Q9UJA5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRMT6Q9UJA5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRMT6Q9UJA5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRMT6Q9UJA5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TRMT6Q9UJA5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRMT6Q9UJA5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRMT6Q9UJA5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRMT6Q9UJA5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRMT6Q9UJA5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRMT6Q9UJA5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TRMT6Q9UJA5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRMT6Q9UJA5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRMT6Q9UJA5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRMT6Q9UJA5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.4 ms