Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI7

SLC23A1, Solute carrier family 23 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC23A1Q9UHI7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC23A1Q9UHI7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC23A1Q9UHI7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC23A1Q9UHI7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC23A1Q9UHI7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC23A1Q9UHI7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC23A1Q9UHI7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC23A1Q9UHI7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC23A1Q9UHI7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC23A1Q9UHI7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC23A1Q9UHI7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC23A1Q9UHI7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC23A1Q9UHI7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC23A1Q9UHI7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC23A1Q9UHI7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC23A1Q9UHI7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC23A1Q9UHI7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC23A1Q9UHI7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC23A1Q9UHI7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC23A1Q9UHI7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC23A1Q9UHI7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC23A1Q9UHI7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC23A1Q9UHI7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC23A1Q9UHI7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC23A1Q9UHI7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC23A1Q9UHI7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC23A1Q9UHI7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC23A1Q9UHI7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC23A1Q9UHI7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC23A1Q9UHI7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC23A1Q9UHI7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC23A1Q9UHI7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC23A1Q9UHI7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC23A1Q9UHI7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC23A1Q9UHI7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC23A1Q9UHI7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC23A1Q9UHI7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC23A1Q9UHI7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC23A1Q9UHI7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC23A1Q9UHI7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC23A1Q9UHI7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC23A1Q9UHI7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC23A1Q9UHI7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC23A1Q9UHI7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC23A1Q9UHI7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC23A1Q9UHI7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC23A1Q9UHI7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC23A1Q9UHI7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC23A1Q9UHI7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC23A1Q9UHI7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC23A1Q9UHI7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC23A1Q9UHI7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC23A1Q9UHI7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC23A1Q9UHI7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC23A1Q9UHI7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC23A1Q9UHI7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC23A1Q9UHI7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC23A1Q9UHI7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC23A1Q9UHI7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC23A1Q9UHI7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC23A1Q9UHI7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC23A1Q9UHI7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC23A1Q9UHI7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC23A1Q9UHI7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC23A1Q9UHI7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC23A1Q9UHI7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC23A1Q9UHI7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC23A1Q9UHI7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC23A1Q9UHI7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC23A1Q9UHI7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC23A1Q9UHI7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC23A1Q9UHI7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC23A1Q9UHI7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC23A1Q9UHI7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC23A1Q9UHI7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC23A1Q9UHI7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC23A1Q9UHI7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC23A1Q9UHI7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC23A1Q9UHI7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC23A1Q9UHI7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC23A1Q9UHI7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC23A1Q9UHI7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC23A1Q9UHI7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC23A1Q9UHI7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC23A1Q9UHI7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC23A1Q9UHI7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC23A1Q9UHI7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC23A1Q9UHI7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC23A1Q9UHI7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC23A1Q9UHI7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC23A1Q9UHI7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC23A1Q9UHI7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC23A1Q9UHI7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC23A1Q9UHI7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC23A1Q9UHI7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC23A1Q9UHI7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC23A1Q9UHI7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC23A1Q9UHI7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC23A1Q9UHI7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC23A1Q9UHI7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms