Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGV2

NDRG3, Protein NDRG3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG3Q9UGV2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDRG3Q9UGV2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDRG3Q9UGV2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDRG3Q9UGV2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDRG3Q9UGV2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDRG3Q9UGV2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDRG3Q9UGV2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDRG3Q9UGV2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDRG3Q9UGV2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDRG3Q9UGV2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDRG3Q9UGV2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDRG3Q9UGV2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDRG3Q9UGV2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDRG3Q9UGV2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDRG3Q9UGV2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDRG3Q9UGV2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDRG3Q9UGV2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDRG3Q9UGV2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDRG3Q9UGV2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDRG3Q9UGV2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDRG3Q9UGV2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDRG3Q9UGV2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDRG3Q9UGV2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDRG3Q9UGV2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDRG3Q9UGV2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDRG3Q9UGV2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDRG3Q9UGV2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDRG3Q9UGV2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NDRG3Q9UGV2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDRG3Q9UGV2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDRG3Q9UGV2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDRG3Q9UGV2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDRG3Q9UGV2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDRG3Q9UGV2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDRG3Q9UGV2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDRG3Q9UGV2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDRG3Q9UGV2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDRG3Q9UGV2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDRG3Q9UGV2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDRG3Q9UGV2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDRG3Q9UGV2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDRG3Q9UGV2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDRG3Q9UGV2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDRG3Q9UGV2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDRG3Q9UGV2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDRG3Q9UGV2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NDRG3Q9UGV2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDRG3Q9UGV2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDRG3Q9UGV2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDRG3Q9UGV2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDRG3Q9UGV2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDRG3Q9UGV2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDRG3Q9UGV2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDRG3Q9UGV2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDRG3Q9UGV2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDRG3Q9UGV2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDRG3Q9UGV2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDRG3Q9UGV2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDRG3Q9UGV2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDRG3Q9UGV2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDRG3Q9UGV2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDRG3Q9UGV2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDRG3Q9UGV2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NDRG3Q9UGV2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDRG3Q9UGV2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NDRG3Q9UGV2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDRG3Q9UGV2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDRG3Q9UGV2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDRG3Q9UGV2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDRG3Q9UGV2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDRG3Q9UGV2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDRG3Q9UGV2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDRG3Q9UGV2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDRG3Q9UGV2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDRG3Q9UGV2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDRG3Q9UGV2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDRG3Q9UGV2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDRG3Q9UGV2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDRG3Q9UGV2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NDRG3Q9UGV2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDRG3Q9UGV2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NDRG3Q9UGV2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDRG3Q9UGV2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDRG3Q9UGV2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NDRG3Q9UGV2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDRG3Q9UGV2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDRG3Q9UGV2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDRG3Q9UGV2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDRG3Q9UGV2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDRG3Q9UGV2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDRG3Q9UGV2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDRG3Q9UGV2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDRG3Q9UGV2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NDRG3Q9UGV2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDRG3Q9UGV2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDRG3Q9UGV2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDRG3Q9UGV2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDRG3Q9UGV2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDRG3Q9UGV2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDRG3Q9UGV2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.6 ms