Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U7

SLC17A7, Vesicular glutamate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A7Q9P2U7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC17A7Q9P2U7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC17A7Q9P2U7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC17A7Q9P2U7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC17A7Q9P2U7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC17A7Q9P2U7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC17A7Q9P2U7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC17A7Q9P2U7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC17A7Q9P2U7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC17A7Q9P2U7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC17A7Q9P2U7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC17A7Q9P2U7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC17A7Q9P2U7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC17A7Q9P2U7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC17A7Q9P2U7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC17A7Q9P2U7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC17A7Q9P2U7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC17A7Q9P2U7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC17A7Q9P2U7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC17A7Q9P2U7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC17A7Q9P2U7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC17A7Q9P2U7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC17A7Q9P2U7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC17A7Q9P2U7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC17A7Q9P2U7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC17A7Q9P2U7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC17A7Q9P2U7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC17A7Q9P2U7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC17A7Q9P2U7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC17A7Q9P2U7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC17A7Q9P2U7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC17A7Q9P2U7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC17A7Q9P2U7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC17A7Q9P2U7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC17A7Q9P2U7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC17A7Q9P2U7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC17A7Q9P2U7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC17A7Q9P2U7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC17A7Q9P2U7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC17A7Q9P2U7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC17A7Q9P2U7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC17A7Q9P2U7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC17A7Q9P2U7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC17A7Q9P2U7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC17A7Q9P2U7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC17A7Q9P2U7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC17A7Q9P2U7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC17A7Q9P2U7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC17A7Q9P2U7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC17A7Q9P2U7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC17A7Q9P2U7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC17A7Q9P2U7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC17A7Q9P2U7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC17A7Q9P2U7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC17A7Q9P2U7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC17A7Q9P2U7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC17A7Q9P2U7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC17A7Q9P2U7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC17A7Q9P2U7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC17A7Q9P2U7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC17A7Q9P2U7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC17A7Q9P2U7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC17A7Q9P2U7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC17A7Q9P2U7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC17A7Q9P2U7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC17A7Q9P2U7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC17A7Q9P2U7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC17A7Q9P2U7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC17A7Q9P2U7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC17A7Q9P2U7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC17A7Q9P2U7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC17A7Q9P2U7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC17A7Q9P2U7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC17A7Q9P2U7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC17A7Q9P2U7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC17A7Q9P2U7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC17A7Q9P2U7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC17A7Q9P2U7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC17A7Q9P2U7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC17A7Q9P2U7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC17A7Q9P2U7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC17A7Q9P2U7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC17A7Q9P2U7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC17A7Q9P2U7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC17A7Q9P2U7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC17A7Q9P2U7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC17A7Q9P2U7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC17A7Q9P2U7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC17A7Q9P2U7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC17A7Q9P2U7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC17A7Q9P2U7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC17A7Q9P2U7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC17A7Q9P2U7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC17A7Q9P2U7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC17A7Q9P2U7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC17A7Q9P2U7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC17A7Q9P2U7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC17A7Q9P2U7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC17A7Q9P2U7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC17A7Q9P2U7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms