Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3BP4Q9P0V3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3BP4Q9P0V3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3BP4Q9P0V3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3BP4Q9P0V3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3BP4Q9P0V3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3BP4Q9P0V3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3BP4Q9P0V3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3BP4Q9P0V3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3BP4Q9P0V3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3BP4Q9P0V3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3BP4Q9P0V3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3BP4Q9P0V3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3BP4Q9P0V3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3BP4Q9P0V3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3BP4Q9P0V3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3BP4Q9P0V3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3BP4Q9P0V3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3BP4Q9P0V3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3BP4Q9P0V3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3BP4Q9P0V3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3BP4Q9P0V3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SH3BP4Q9P0V3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SH3BP4Q9P0V3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3BP4Q9P0V3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3BP4Q9P0V3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3BP4Q9P0V3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3BP4Q9P0V3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3BP4Q9P0V3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3BP4Q9P0V3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3BP4Q9P0V3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3BP4Q9P0V3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3BP4Q9P0V3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3BP4Q9P0V3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3BP4Q9P0V3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3BP4Q9P0V3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3BP4Q9P0V3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3BP4Q9P0V3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3BP4Q9P0V3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3BP4Q9P0V3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3BP4Q9P0V3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3BP4Q9P0V3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3BP4Q9P0V3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3BP4Q9P0V3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3BP4Q9P0V3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3BP4Q9P0V3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3BP4Q9P0V3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3BP4Q9P0V3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3BP4Q9P0V3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3BP4Q9P0V3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3BP4Q9P0V3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3BP4Q9P0V3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3BP4Q9P0V3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3BP4Q9P0V3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3BP4Q9P0V3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3BP4Q9P0V3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3BP4Q9P0V3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3BP4Q9P0V3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3BP4Q9P0V3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3BP4Q9P0V3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3BP4Q9P0V3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3BP4Q9P0V3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3BP4Q9P0V3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3BP4Q9P0V3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3BP4Q9P0V3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3BP4Q9P0V3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3BP4Q9P0V3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3BP4Q9P0V3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3BP4Q9P0V3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3BP4Q9P0V3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3BP4Q9P0V3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3BP4Q9P0V3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3BP4Q9P0V3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3BP4Q9P0V3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3BP4Q9P0V3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3BP4Q9P0V3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3BP4Q9P0V3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3BP4Q9P0V3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3BP4Q9P0V3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3BP4Q9P0V3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3BP4Q9P0V3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3BP4Q9P0V3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3BP4Q9P0V3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3BP4Q9P0V3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3BP4Q9P0V3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3BP4Q9P0V3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3BP4Q9P0V3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3BP4Q9P0V3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3BP4Q9P0V3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3BP4Q9P0V3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SH3BP4Q9P0V3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SH3BP4Q9P0V3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3BP4Q9P0V3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms