Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0T7

TMEM9, Transmembrane protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM9Q9P0T7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM9Q9P0T7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM9Q9P0T7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM9Q9P0T7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM9Q9P0T7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM9Q9P0T7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM9Q9P0T7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM9Q9P0T7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM9Q9P0T7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM9Q9P0T7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM9Q9P0T7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM9Q9P0T7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM9Q9P0T7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM9Q9P0T7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM9Q9P0T7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM9Q9P0T7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM9Q9P0T7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM9Q9P0T7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM9Q9P0T7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM9Q9P0T7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM9Q9P0T7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM9Q9P0T7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM9Q9P0T7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM9Q9P0T7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM9Q9P0T7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM9Q9P0T7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM9Q9P0T7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM9Q9P0T7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM9Q9P0T7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM9Q9P0T7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM9Q9P0T7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM9Q9P0T7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM9Q9P0T7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM9Q9P0T7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM9Q9P0T7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM9Q9P0T7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM9Q9P0T7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM9Q9P0T7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM9Q9P0T7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM9Q9P0T7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM9Q9P0T7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM9Q9P0T7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM9Q9P0T7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM9Q9P0T7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM9Q9P0T7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM9Q9P0T7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM9Q9P0T7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM9Q9P0T7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM9Q9P0T7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM9Q9P0T7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM9Q9P0T7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM9Q9P0T7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM9Q9P0T7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM9Q9P0T7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM9Q9P0T7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM9Q9P0T7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM9Q9P0T7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM9Q9P0T7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM9Q9P0T7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM9Q9P0T7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM9Q9P0T7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM9Q9P0T7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM9Q9P0T7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM9Q9P0T7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM9Q9P0T7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM9Q9P0T7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM9Q9P0T7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM9Q9P0T7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM9Q9P0T7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM9Q9P0T7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM9Q9P0T7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM9Q9P0T7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM9Q9P0T7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM9Q9P0T7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM9Q9P0T7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM9Q9P0T7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM9Q9P0T7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM9Q9P0T7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM9Q9P0T7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM9Q9P0T7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM9Q9P0T7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM9Q9P0T7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM9Q9P0T7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM9Q9P0T7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM9Q9P0T7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM9Q9P0T7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM9Q9P0T7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM9Q9P0T7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM9Q9P0T7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM9Q9P0T7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM9Q9P0T7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM9Q9P0T7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM9Q9P0T7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM9Q9P0T7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM9Q9P0T7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM9Q9P0T7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM9Q9P0T7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM9Q9P0T7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM9Q9P0T7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM9Q9P0T7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms