Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN8

CNOT2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT2Q9NZN8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNOT2Q9NZN8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNOT2Q9NZN8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNOT2Q9NZN8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNOT2Q9NZN8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNOT2Q9NZN8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNOT2Q9NZN8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNOT2Q9NZN8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNOT2Q9NZN8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT2Q9NZN8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNOT2Q9NZN8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNOT2Q9NZN8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNOT2Q9NZN8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNOT2Q9NZN8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNOT2Q9NZN8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNOT2Q9NZN8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNOT2Q9NZN8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNOT2Q9NZN8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNOT2Q9NZN8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNOT2Q9NZN8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNOT2Q9NZN8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNOT2Q9NZN8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT2Q9NZN8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT2Q9NZN8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT2Q9NZN8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT2Q9NZN8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNOT2Q9NZN8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNOT2Q9NZN8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNOT2Q9NZN8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNOT2Q9NZN8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNOT2Q9NZN8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNOT2Q9NZN8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNOT2Q9NZN8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNOT2Q9NZN8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNOT2Q9NZN8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNOT2Q9NZN8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNOT2Q9NZN8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT2Q9NZN8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT2Q9NZN8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT2Q9NZN8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT2Q9NZN8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT2Q9NZN8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT2Q9NZN8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNOT2Q9NZN8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNOT2Q9NZN8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNOT2Q9NZN8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNOT2Q9NZN8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT2Q9NZN8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT2Q9NZN8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT2Q9NZN8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT2Q9NZN8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT2Q9NZN8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT2Q9NZN8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT2Q9NZN8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNOT2Q9NZN8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNOT2Q9NZN8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT2Q9NZN8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT2Q9NZN8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT2Q9NZN8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT2Q9NZN8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT2Q9NZN8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT2Q9NZN8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT2Q9NZN8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT2Q9NZN8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT2Q9NZN8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT2Q9NZN8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT2Q9NZN8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT2Q9NZN8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT2Q9NZN8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT2Q9NZN8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT2Q9NZN8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT2Q9NZN8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT2Q9NZN8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CNOT2Q9NZN8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNOT2Q9NZN8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNOT2Q9NZN8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNOT2Q9NZN8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNOT2Q9NZN8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNOT2Q9NZN8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNOT2Q9NZN8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNOT2Q9NZN8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNOT2Q9NZN8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNOT2Q9NZN8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT2Q9NZN8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT2Q9NZN8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT2Q9NZN8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT2Q9NZN8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT2Q9NZN8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT2Q9NZN8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT2Q9NZN8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT2Q9NZN8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT2Q9NZN8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT2Q9NZN8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT2Q9NZN8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT2Q9NZN8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT2Q9NZN8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT2Q9NZN8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT2Q9NZN8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT2Q9NZN8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNOT2Q9NZN8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms