Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI7

UBP1, Upstream-binding protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1Q9NZI7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBP1Q9NZI7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBP1Q9NZI7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBP1Q9NZI7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBP1Q9NZI7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
UBP1Q9NZI7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBP1Q9NZI7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBP1Q9NZI7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBP1Q9NZI7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
UBP1Q9NZI7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBP1Q9NZI7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBP1Q9NZI7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBP1Q9NZI7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
UBP1Q9NZI7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBP1Q9NZI7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBP1Q9NZI7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBP1Q9NZI7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBP1Q9NZI7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBP1Q9NZI7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBP1Q9NZI7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBP1Q9NZI7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBP1Q9NZI7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBP1Q9NZI7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBP1Q9NZI7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBP1Q9NZI7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBP1Q9NZI7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBP1Q9NZI7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
UBP1Q9NZI7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBP1Q9NZI7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
UBP1Q9NZI7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBP1Q9NZI7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBP1Q9NZI7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBP1Q9NZI7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
UBP1Q9NZI7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBP1Q9NZI7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBP1Q9NZI7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBP1Q9NZI7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBP1Q9NZI7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
UBP1Q9NZI7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBP1Q9NZI7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBP1Q9NZI7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
UBP1Q9NZI7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBP1Q9NZI7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UBP1Q9NZI7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBP1Q9NZI7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26■■□□□ 1.75
UBP1Q9NZI7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UBP1Q9NZI7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
UBP1Q9NZI7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBP1Q9NZI7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBP1Q9NZI7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBP1Q9NZI7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBP1Q9NZI7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBP1Q9NZI7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBP1Q9NZI7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBP1Q9NZI7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBP1Q9NZI7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBP1Q9NZI7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBP1Q9NZI7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBP1Q9NZI7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBP1Q9NZI7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBP1Q9NZI7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBP1Q9NZI7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBP1Q9NZI7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBP1Q9NZI7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBP1Q9NZI7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBP1Q9NZI7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBP1Q9NZI7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBP1Q9NZI7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
UBP1Q9NZI7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
UBP1Q9NZI7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBP1Q9NZI7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBP1Q9NZI7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBP1Q9NZI7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBP1Q9NZI7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBP1Q9NZI7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBP1Q9NZI7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBP1Q9NZI7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBP1Q9NZI7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBP1Q9NZI7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBP1Q9NZI7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBP1Q9NZI7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
UBP1Q9NZI7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBP1Q9NZI7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBP1Q9NZI7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBP1Q9NZI7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBP1Q9NZI7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBP1Q9NZI7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBP1Q9NZI7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBP1Q9NZI7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBP1Q9NZI7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBP1Q9NZI7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBP1Q9NZI7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBP1Q9NZI7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBP1Q9NZI7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBP1Q9NZI7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBP1Q9NZI7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBP1Q9NZI7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBP1Q9NZI7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBP1Q9NZI7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBP1Q9NZI7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
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