Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL28Q9NXS3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL28Q9NXS3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL28Q9NXS3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL28Q9NXS3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL28Q9NXS3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL28Q9NXS3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL28Q9NXS3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL28Q9NXS3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL28Q9NXS3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL28Q9NXS3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL28Q9NXS3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL28Q9NXS3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL28Q9NXS3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL28Q9NXS3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL28Q9NXS3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL28Q9NXS3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL28Q9NXS3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL28Q9NXS3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL28Q9NXS3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL28Q9NXS3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL28Q9NXS3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL28Q9NXS3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL28Q9NXS3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL28Q9NXS3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL28Q9NXS3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL28Q9NXS3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL28Q9NXS3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL28Q9NXS3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL28Q9NXS3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL28Q9NXS3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL28Q9NXS3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL28Q9NXS3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL28Q9NXS3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL28Q9NXS3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL28Q9NXS3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL28Q9NXS3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL28Q9NXS3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL28Q9NXS3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL28Q9NXS3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL28Q9NXS3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL28Q9NXS3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL28Q9NXS3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL28Q9NXS3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL28Q9NXS3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL28Q9NXS3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL28Q9NXS3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL28Q9NXS3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL28Q9NXS3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL28Q9NXS3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL28Q9NXS3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL28Q9NXS3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL28Q9NXS3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL28Q9NXS3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL28Q9NXS3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL28Q9NXS3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL28Q9NXS3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL28Q9NXS3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL28Q9NXS3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL28Q9NXS3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL28Q9NXS3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL28Q9NXS3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL28Q9NXS3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL28Q9NXS3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL28Q9NXS3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL28Q9NXS3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL28Q9NXS3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL28Q9NXS3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL28Q9NXS3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL28Q9NXS3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL28Q9NXS3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL28Q9NXS3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL28Q9NXS3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL28Q9NXS3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL28Q9NXS3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL28Q9NXS3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL28Q9NXS3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL28Q9NXS3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL28Q9NXS3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL28Q9NXS3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL28Q9NXS3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL28Q9NXS3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL28Q9NXS3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL28Q9NXS3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL28Q9NXS3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL28Q9NXS3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL28Q9NXS3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL28Q9NXS3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL28Q9NXS3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL28Q9NXS3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL28Q9NXS3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL28Q9NXS3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL28Q9NXS3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KLHL28Q9NXS3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL28Q9NXS3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL28Q9NXS3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL28Q9NXS3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL28Q9NXS3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL28Q9NXS3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL28Q9NXS3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms