Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWT1

PAK1IP1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK1IP1Q9NWT1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PAK1IP1Q9NWT1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAK1IP1Q9NWT1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PAK1IP1Q9NWT1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAK1IP1Q9NWT1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PAK1IP1Q9NWT1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAK1IP1Q9NWT1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAK1IP1Q9NWT1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAK1IP1Q9NWT1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAK1IP1Q9NWT1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAK1IP1Q9NWT1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAK1IP1Q9NWT1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAK1IP1Q9NWT1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAK1IP1Q9NWT1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PAK1IP1Q9NWT1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAK1IP1Q9NWT1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAK1IP1Q9NWT1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAK1IP1Q9NWT1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAK1IP1Q9NWT1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAK1IP1Q9NWT1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAK1IP1Q9NWT1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAK1IP1Q9NWT1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAK1IP1Q9NWT1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAK1IP1Q9NWT1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAK1IP1Q9NWT1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAK1IP1Q9NWT1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAK1IP1Q9NWT1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAK1IP1Q9NWT1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAK1IP1Q9NWT1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAK1IP1Q9NWT1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAK1IP1Q9NWT1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAK1IP1Q9NWT1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAK1IP1Q9NWT1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PAK1IP1Q9NWT1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAK1IP1Q9NWT1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAK1IP1Q9NWT1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAK1IP1Q9NWT1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAK1IP1Q9NWT1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAK1IP1Q9NWT1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAK1IP1Q9NWT1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAK1IP1Q9NWT1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAK1IP1Q9NWT1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PAK1IP1Q9NWT1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAK1IP1Q9NWT1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAK1IP1Q9NWT1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAK1IP1Q9NWT1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAK1IP1Q9NWT1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAK1IP1Q9NWT1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAK1IP1Q9NWT1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAK1IP1Q9NWT1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAK1IP1Q9NWT1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PAK1IP1Q9NWT1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAK1IP1Q9NWT1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAK1IP1Q9NWT1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAK1IP1Q9NWT1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAK1IP1Q9NWT1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PAK1IP1Q9NWT1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAK1IP1Q9NWT1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAK1IP1Q9NWT1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAK1IP1Q9NWT1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAK1IP1Q9NWT1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PAK1IP1Q9NWT1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAK1IP1Q9NWT1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAK1IP1Q9NWT1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAK1IP1Q9NWT1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAK1IP1Q9NWT1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAK1IP1Q9NWT1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAK1IP1Q9NWT1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAK1IP1Q9NWT1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAK1IP1Q9NWT1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAK1IP1Q9NWT1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAK1IP1Q9NWT1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAK1IP1Q9NWT1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAK1IP1Q9NWT1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAK1IP1Q9NWT1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAK1IP1Q9NWT1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAK1IP1Q9NWT1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAK1IP1Q9NWT1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAK1IP1Q9NWT1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAK1IP1Q9NWT1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAK1IP1Q9NWT1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PAK1IP1Q9NWT1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PAK1IP1Q9NWT1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAK1IP1Q9NWT1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAK1IP1Q9NWT1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAK1IP1Q9NWT1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAK1IP1Q9NWT1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAK1IP1Q9NWT1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAK1IP1Q9NWT1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAK1IP1Q9NWT1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAK1IP1Q9NWT1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAK1IP1Q9NWT1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAK1IP1Q9NWT1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAK1IP1Q9NWT1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PAK1IP1Q9NWT1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAK1IP1Q9NWT1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAK1IP1Q9NWT1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms