Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ7

UFSP2, Ufm1-specific protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP2Q9NUQ7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UFSP2Q9NUQ7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UFSP2Q9NUQ7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UFSP2Q9NUQ7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UFSP2Q9NUQ7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UFSP2Q9NUQ7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UFSP2Q9NUQ7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UFSP2Q9NUQ7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UFSP2Q9NUQ7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UFSP2Q9NUQ7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UFSP2Q9NUQ7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UFSP2Q9NUQ7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UFSP2Q9NUQ7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UFSP2Q9NUQ7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UFSP2Q9NUQ7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UFSP2Q9NUQ7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UFSP2Q9NUQ7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UFSP2Q9NUQ7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UFSP2Q9NUQ7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UFSP2Q9NUQ7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UFSP2Q9NUQ7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UFSP2Q9NUQ7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UFSP2Q9NUQ7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UFSP2Q9NUQ7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UFSP2Q9NUQ7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UFSP2Q9NUQ7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UFSP2Q9NUQ7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UFSP2Q9NUQ7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UFSP2Q9NUQ7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UFSP2Q9NUQ7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UFSP2Q9NUQ7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UFSP2Q9NUQ7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UFSP2Q9NUQ7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UFSP2Q9NUQ7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UFSP2Q9NUQ7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
UFSP2Q9NUQ7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UFSP2Q9NUQ7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UFSP2Q9NUQ7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UFSP2Q9NUQ7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UFSP2Q9NUQ7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UFSP2Q9NUQ7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UFSP2Q9NUQ7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UFSP2Q9NUQ7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UFSP2Q9NUQ7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UFSP2Q9NUQ7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UFSP2Q9NUQ7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
UFSP2Q9NUQ7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UFSP2Q9NUQ7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
UFSP2Q9NUQ7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UFSP2Q9NUQ7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UFSP2Q9NUQ7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
UFSP2Q9NUQ7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
UFSP2Q9NUQ7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UFSP2Q9NUQ7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UFSP2Q9NUQ7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
UFSP2Q9NUQ7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UFSP2Q9NUQ7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
UFSP2Q9NUQ7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UFSP2Q9NUQ7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UFSP2Q9NUQ7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UFSP2Q9NUQ7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UFSP2Q9NUQ7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UFSP2Q9NUQ7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UFSP2Q9NUQ7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UFSP2Q9NUQ7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UFSP2Q9NUQ7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UFSP2Q9NUQ7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UFSP2Q9NUQ7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UFSP2Q9NUQ7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UFSP2Q9NUQ7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UFSP2Q9NUQ7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UFSP2Q9NUQ7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UFSP2Q9NUQ7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
UFSP2Q9NUQ7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UFSP2Q9NUQ7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UFSP2Q9NUQ7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UFSP2Q9NUQ7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UFSP2Q9NUQ7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UFSP2Q9NUQ7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UFSP2Q9NUQ7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UFSP2Q9NUQ7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UFSP2Q9NUQ7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UFSP2Q9NUQ7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UFSP2Q9NUQ7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UFSP2Q9NUQ7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UFSP2Q9NUQ7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UFSP2Q9NUQ7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UFSP2Q9NUQ7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
UFSP2Q9NUQ7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UFSP2Q9NUQ7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UFSP2Q9NUQ7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UFSP2Q9NUQ7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UFSP2Q9NUQ7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UFSP2Q9NUQ7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UFSP2Q9NUQ7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UFSP2Q9NUQ7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UFSP2Q9NUQ7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UFSP2Q9NUQ7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UFSP2Q9NUQ7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UFSP2Q9NUQ7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms