Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPMQ9NSP4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPMQ9NSP4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPMQ9NSP4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPMQ9NSP4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPMQ9NSP4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPMQ9NSP4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CENPMQ9NSP4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPMQ9NSP4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPMQ9NSP4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPMQ9NSP4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPMQ9NSP4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPMQ9NSP4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPMQ9NSP4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPMQ9NSP4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPMQ9NSP4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPMQ9NSP4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPMQ9NSP4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPMQ9NSP4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPMQ9NSP4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPMQ9NSP4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPMQ9NSP4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPMQ9NSP4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPMQ9NSP4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPMQ9NSP4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPMQ9NSP4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPMQ9NSP4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPMQ9NSP4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPMQ9NSP4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPMQ9NSP4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPMQ9NSP4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPMQ9NSP4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPMQ9NSP4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPMQ9NSP4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPMQ9NSP4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPMQ9NSP4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPMQ9NSP4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPMQ9NSP4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPMQ9NSP4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPMQ9NSP4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPMQ9NSP4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPMQ9NSP4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPMQ9NSP4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPMQ9NSP4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPMQ9NSP4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPMQ9NSP4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPMQ9NSP4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPMQ9NSP4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPMQ9NSP4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPMQ9NSP4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPMQ9NSP4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPMQ9NSP4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPMQ9NSP4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPMQ9NSP4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPMQ9NSP4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPMQ9NSP4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPMQ9NSP4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPMQ9NSP4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPMQ9NSP4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPMQ9NSP4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPMQ9NSP4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPMQ9NSP4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPMQ9NSP4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPMQ9NSP4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPMQ9NSP4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPMQ9NSP4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPMQ9NSP4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPMQ9NSP4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPMQ9NSP4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPMQ9NSP4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CENPMQ9NSP4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPMQ9NSP4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPMQ9NSP4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPMQ9NSP4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPMQ9NSP4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPMQ9NSP4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPMQ9NSP4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPMQ9NSP4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPMQ9NSP4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPMQ9NSP4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPMQ9NSP4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPMQ9NSP4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPMQ9NSP4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPMQ9NSP4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPMQ9NSP4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPMQ9NSP4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPMQ9NSP4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPMQ9NSP4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPMQ9NSP4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPMQ9NSP4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPMQ9NSP4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPMQ9NSP4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPMQ9NSP4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPMQ9NSP4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPMQ9NSP4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPMQ9NSP4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPMQ9NSP4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPMQ9NSP4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPMQ9NSP4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPMQ9NSP4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms