Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR96

TLR9, Toll-like receptor 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR9Q9NR96 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TLR9Q9NR96 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TLR9Q9NR96 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TLR9Q9NR96 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TLR9Q9NR96 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TLR9Q9NR96 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TLR9Q9NR96 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TLR9Q9NR96 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TLR9Q9NR96 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TLR9Q9NR96 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TLR9Q9NR96 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TLR9Q9NR96 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TLR9Q9NR96 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TLR9Q9NR96 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TLR9Q9NR96 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TLR9Q9NR96 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TLR9Q9NR96 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TLR9Q9NR96 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TLR9Q9NR96 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TLR9Q9NR96 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TLR9Q9NR96 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TLR9Q9NR96 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TLR9Q9NR96 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TLR9Q9NR96 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TLR9Q9NR96 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TLR9Q9NR96 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TLR9Q9NR96 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TLR9Q9NR96 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TLR9Q9NR96 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TLR9Q9NR96 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TLR9Q9NR96 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TLR9Q9NR96 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TLR9Q9NR96 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TLR9Q9NR96 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TLR9Q9NR96 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TLR9Q9NR96 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TLR9Q9NR96 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TLR9Q9NR96 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TLR9Q9NR96 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TLR9Q9NR96 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TLR9Q9NR96 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TLR9Q9NR96 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TLR9Q9NR96 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TLR9Q9NR96 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TLR9Q9NR96 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TLR9Q9NR96 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TLR9Q9NR96 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TLR9Q9NR96 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TLR9Q9NR96 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TLR9Q9NR96 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TLR9Q9NR96 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TLR9Q9NR96 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TLR9Q9NR96 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TLR9Q9NR96 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TLR9Q9NR96 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TLR9Q9NR96 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TLR9Q9NR96 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TLR9Q9NR96 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TLR9Q9NR96 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TLR9Q9NR96 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TLR9Q9NR96 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TLR9Q9NR96 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TLR9Q9NR96 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TLR9Q9NR96 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TLR9Q9NR96 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TLR9Q9NR96 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TLR9Q9NR96 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TLR9Q9NR96 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TLR9Q9NR96 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TLR9Q9NR96 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TLR9Q9NR96 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TLR9Q9NR96 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TLR9Q9NR96 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TLR9Q9NR96 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TLR9Q9NR96 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TLR9Q9NR96 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TLR9Q9NR96 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TLR9Q9NR96 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TLR9Q9NR96 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TLR9Q9NR96 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TLR9Q9NR96 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TLR9Q9NR96 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TLR9Q9NR96 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TLR9Q9NR96 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TLR9Q9NR96 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TLR9Q9NR96 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TLR9Q9NR96 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TLR9Q9NR96 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TLR9Q9NR96 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TLR9Q9NR96 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TLR9Q9NR96 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TLR9Q9NR96 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TLR9Q9NR96 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TLR9Q9NR96 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TLR9Q9NR96 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TLR9Q9NR96 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TLR9Q9NR96 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TLR9Q9NR96 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TLR9Q9NR96 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TLR9Q9NR96 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms