Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR16

CD163L1, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M160, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163L1Q9NR16 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CD163L1Q9NR16 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CD163L1Q9NR16 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CD163L1Q9NR16 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CD163L1Q9NR16 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CD163L1Q9NR16 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
CD163L1Q9NR16 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CD163L1Q9NR16 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CD163L1Q9NR16 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CD163L1Q9NR16 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CD163L1Q9NR16 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CD163L1Q9NR16 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CD163L1Q9NR16 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CD163L1Q9NR16 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CD163L1Q9NR16 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CD163L1Q9NR16 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.26
CD163L1Q9NR16 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CD163L1Q9NR16 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CD163L1Q9NR16 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CD163L1Q9NR16 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CD163L1Q9NR16 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CD163L1Q9NR16 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CD163L1Q9NR16 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CD163L1Q9NR16 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
CD163L1Q9NR16 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CD163L1Q9NR16 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CD163L1Q9NR16 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CD163L1Q9NR16 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CD163L1Q9NR16 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CD163L1Q9NR16 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CD163L1Q9NR16 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CD163L1Q9NR16 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CD163L1Q9NR16 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CD163L1Q9NR16 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CD163L1Q9NR16 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CD163L1Q9NR16 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CD163L1Q9NR16 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CD163L1Q9NR16 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CD163L1Q9NR16 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CD163L1Q9NR16 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CD163L1Q9NR16 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CD163L1Q9NR16 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CD163L1Q9NR16 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CD163L1Q9NR16 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CD163L1Q9NR16 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CD163L1Q9NR16 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
CD163L1Q9NR16 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CD163L1Q9NR16 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CD163L1Q9NR16 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CD163L1Q9NR16 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CD163L1Q9NR16 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CD163L1Q9NR16 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CD163L1Q9NR16 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CD163L1Q9NR16 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CD163L1Q9NR16 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CD163L1Q9NR16 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CD163L1Q9NR16 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CD163L1Q9NR16 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CD163L1Q9NR16 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CD163L1Q9NR16 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CD163L1Q9NR16 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC35.26■■■■□ 3.23
CD163L1Q9NR16 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CD163L1Q9NR16 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CD163L1Q9NR16 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CD163L1Q9NR16 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
CD163L1Q9NR16 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
CD163L1Q9NR16 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CD163L1Q9NR16 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CD163L1Q9NR16 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CD163L1Q9NR16 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
CD163L1Q9NR16 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CD163L1Q9NR16 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CD163L1Q9NR16 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CD163L1Q9NR16 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CD163L1Q9NR16 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CD163L1Q9NR16 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CD163L1Q9NR16 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CD163L1Q9NR16 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CD163L1Q9NR16 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
CD163L1Q9NR16 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CD163L1Q9NR16 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CD163L1Q9NR16 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CD163L1Q9NR16 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CD163L1Q9NR16 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CD163L1Q9NR16 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CD163L1Q9NR16 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CD163L1Q9NR16 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CD163L1Q9NR16 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CD163L1Q9NR16 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CD163L1Q9NR16 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CD163L1Q9NR16 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CD163L1Q9NR16 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CD163L1Q9NR16 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CD163L1Q9NR16 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CD163L1Q9NR16 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CD163L1Q9NR16 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CD163L1Q9NR16 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CD163L1Q9NR16 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CD163L1Q9NR16 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CD163L1Q9NR16 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms