Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SEC31BQ9NQW1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SEC31BQ9NQW1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SEC31BQ9NQW1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SEC31BQ9NQW1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SEC31BQ9NQW1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SEC31BQ9NQW1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SEC31BQ9NQW1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SEC31BQ9NQW1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.73
SEC31BQ9NQW1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SEC31BQ9NQW1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SEC31BQ9NQW1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
SEC31BQ9NQW1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SEC31BQ9NQW1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SEC31BQ9NQW1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SEC31BQ9NQW1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SEC31BQ9NQW1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SEC31BQ9NQW1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SEC31BQ9NQW1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
SEC31BQ9NQW1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SEC31BQ9NQW1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SEC31BQ9NQW1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SEC31BQ9NQW1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SEC31BQ9NQW1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SEC31BQ9NQW1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
SEC31BQ9NQW1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SEC31BQ9NQW1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SEC31BQ9NQW1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SEC31BQ9NQW1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SEC31BQ9NQW1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SEC31BQ9NQW1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SEC31BQ9NQW1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SEC31BQ9NQW1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SEC31BQ9NQW1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SEC31BQ9NQW1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
SEC31BQ9NQW1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
SEC31BQ9NQW1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
SEC31BQ9NQW1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
SEC31BQ9NQW1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
SEC31BQ9NQW1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SEC31BQ9NQW1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SEC31BQ9NQW1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SEC31BQ9NQW1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SEC31BQ9NQW1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SEC31BQ9NQW1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
SEC31BQ9NQW1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SEC31BQ9NQW1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SEC31BQ9NQW1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SEC31BQ9NQW1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SEC31BQ9NQW1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SEC31BQ9NQW1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SEC31BQ9NQW1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SEC31BQ9NQW1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
SEC31BQ9NQW1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SEC31BQ9NQW1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SEC31BQ9NQW1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
SEC31BQ9NQW1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SEC31BQ9NQW1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SEC31BQ9NQW1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SEC31BQ9NQW1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SEC31BQ9NQW1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
SEC31BQ9NQW1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SEC31BQ9NQW1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SEC31BQ9NQW1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SEC31BQ9NQW1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
SEC31BQ9NQW1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SEC31BQ9NQW1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
SEC31BQ9NQW1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
SEC31BQ9NQW1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SEC31BQ9NQW1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
SEC31BQ9NQW1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SEC31BQ9NQW1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SEC31BQ9NQW1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SEC31BQ9NQW1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SEC31BQ9NQW1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SEC31BQ9NQW1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SEC31BQ9NQW1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SEC31BQ9NQW1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SEC31BQ9NQW1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SEC31BQ9NQW1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.68
SEC31BQ9NQW1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.68
SEC31BQ9NQW1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SEC31BQ9NQW1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SEC31BQ9NQW1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SEC31BQ9NQW1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
SEC31BQ9NQW1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SEC31BQ9NQW1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SEC31BQ9NQW1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SEC31BQ9NQW1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SEC31BQ9NQW1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SEC31BQ9NQW1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SEC31BQ9NQW1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SEC31BQ9NQW1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SEC31BQ9NQW1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SEC31BQ9NQW1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SEC31BQ9NQW1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SEC31BQ9NQW1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SEC31BQ9NQW1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SEC31BQ9NQW1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SEC31BQ9NQW1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms