Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQQ7

SLC35C2, Solute carrier family 35 member C2, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35C2Q9NQQ7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC35C2Q9NQQ7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC35C2Q9NQQ7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC35C2Q9NQQ7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC35C2Q9NQQ7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC35C2Q9NQQ7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC35C2Q9NQQ7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC35C2Q9NQQ7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC35C2Q9NQQ7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC35C2Q9NQQ7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC35C2Q9NQQ7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC35C2Q9NQQ7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC35C2Q9NQQ7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC35C2Q9NQQ7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC35C2Q9NQQ7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC35C2Q9NQQ7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC35C2Q9NQQ7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC35C2Q9NQQ7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC35C2Q9NQQ7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC35C2Q9NQQ7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC35C2Q9NQQ7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC35C2Q9NQQ7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC35C2Q9NQQ7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC35C2Q9NQQ7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC35C2Q9NQQ7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC35C2Q9NQQ7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC35C2Q9NQQ7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC35C2Q9NQQ7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC35C2Q9NQQ7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC35C2Q9NQQ7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC35C2Q9NQQ7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC35C2Q9NQQ7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC35C2Q9NQQ7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC35C2Q9NQQ7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC35C2Q9NQQ7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC35C2Q9NQQ7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC35C2Q9NQQ7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC35C2Q9NQQ7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC35C2Q9NQQ7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC35C2Q9NQQ7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC35C2Q9NQQ7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC35C2Q9NQQ7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC35C2Q9NQQ7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC35C2Q9NQQ7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC35C2Q9NQQ7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC35C2Q9NQQ7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC35C2Q9NQQ7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC35C2Q9NQQ7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC35C2Q9NQQ7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC35C2Q9NQQ7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC35C2Q9NQQ7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC35C2Q9NQQ7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC35C2Q9NQQ7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC35C2Q9NQQ7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC35C2Q9NQQ7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC35C2Q9NQQ7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC35C2Q9NQQ7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC35C2Q9NQQ7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC35C2Q9NQQ7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC35C2Q9NQQ7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC35C2Q9NQQ7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC35C2Q9NQQ7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC35C2Q9NQQ7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC35C2Q9NQQ7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC35C2Q9NQQ7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC35C2Q9NQQ7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC35C2Q9NQQ7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC35C2Q9NQQ7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC35C2Q9NQQ7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC35C2Q9NQQ7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC35C2Q9NQQ7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC35C2Q9NQQ7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC35C2Q9NQQ7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC35C2Q9NQQ7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC35C2Q9NQQ7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC35C2Q9NQQ7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC35C2Q9NQQ7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC35C2Q9NQQ7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC35C2Q9NQQ7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC35C2Q9NQQ7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC35C2Q9NQQ7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC35C2Q9NQQ7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC35C2Q9NQQ7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC35C2Q9NQQ7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC35C2Q9NQQ7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC35C2Q9NQQ7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC35C2Q9NQQ7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC35C2Q9NQQ7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC35C2Q9NQQ7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC35C2Q9NQQ7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC35C2Q9NQQ7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC35C2Q9NQQ7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC35C2Q9NQQ7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC35C2Q9NQQ7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC35C2Q9NQQ7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC35C2Q9NQQ7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC35C2Q9NQQ7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC35C2Q9NQQ7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC35C2Q9NQQ7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC35C2Q9NQQ7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms