Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI1

BRD7, Bromodomain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD7Q9NPI1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRD7Q9NPI1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRD7Q9NPI1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD7Q9NPI1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD7Q9NPI1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD7Q9NPI1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD7Q9NPI1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD7Q9NPI1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRD7Q9NPI1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRD7Q9NPI1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRD7Q9NPI1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRD7Q9NPI1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRD7Q9NPI1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRD7Q9NPI1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRD7Q9NPI1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRD7Q9NPI1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRD7Q9NPI1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRD7Q9NPI1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRD7Q9NPI1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRD7Q9NPI1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRD7Q9NPI1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRD7Q9NPI1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRD7Q9NPI1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BRD7Q9NPI1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRD7Q9NPI1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRD7Q9NPI1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRD7Q9NPI1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRD7Q9NPI1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRD7Q9NPI1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRD7Q9NPI1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRD7Q9NPI1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRD7Q9NPI1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRD7Q9NPI1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRD7Q9NPI1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BRD7Q9NPI1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRD7Q9NPI1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRD7Q9NPI1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRD7Q9NPI1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRD7Q9NPI1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRD7Q9NPI1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRD7Q9NPI1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRD7Q9NPI1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRD7Q9NPI1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRD7Q9NPI1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRD7Q9NPI1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRD7Q9NPI1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRD7Q9NPI1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRD7Q9NPI1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRD7Q9NPI1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRD7Q9NPI1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRD7Q9NPI1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRD7Q9NPI1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRD7Q9NPI1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRD7Q9NPI1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRD7Q9NPI1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRD7Q9NPI1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRD7Q9NPI1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRD7Q9NPI1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BRD7Q9NPI1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRD7Q9NPI1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRD7Q9NPI1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRD7Q9NPI1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRD7Q9NPI1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRD7Q9NPI1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRD7Q9NPI1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRD7Q9NPI1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRD7Q9NPI1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRD7Q9NPI1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRD7Q9NPI1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRD7Q9NPI1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRD7Q9NPI1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRD7Q9NPI1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRD7Q9NPI1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRD7Q9NPI1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRD7Q9NPI1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRD7Q9NPI1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRD7Q9NPI1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BRD7Q9NPI1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRD7Q9NPI1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRD7Q9NPI1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRD7Q9NPI1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRD7Q9NPI1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRD7Q9NPI1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRD7Q9NPI1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRD7Q9NPI1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRD7Q9NPI1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRD7Q9NPI1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRD7Q9NPI1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BRD7Q9NPI1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRD7Q9NPI1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRD7Q9NPI1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BRD7Q9NPI1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRD7Q9NPI1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRD7Q9NPI1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRD7Q9NPI1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BRD7Q9NPI1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRD7Q9NPI1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRD7Q9NPI1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRD7Q9NPI1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRD7Q9NPI1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms