Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE7BQ9NP56 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE7BQ9NP56 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE7BQ9NP56 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE7BQ9NP56 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE7BQ9NP56 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE7BQ9NP56 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDE7BQ9NP56 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDE7BQ9NP56 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDE7BQ9NP56 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE7BQ9NP56 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE7BQ9NP56 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE7BQ9NP56 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE7BQ9NP56 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE7BQ9NP56 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE7BQ9NP56 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE7BQ9NP56 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE7BQ9NP56 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE7BQ9NP56 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE7BQ9NP56 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE7BQ9NP56 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE7BQ9NP56 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE7BQ9NP56 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE7BQ9NP56 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE7BQ9NP56 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE7BQ9NP56 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE7BQ9NP56 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE7BQ9NP56 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE7BQ9NP56 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE7BQ9NP56 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE7BQ9NP56 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE7BQ9NP56 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE7BQ9NP56 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE7BQ9NP56 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE7BQ9NP56 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE7BQ9NP56 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE7BQ9NP56 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE7BQ9NP56 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE7BQ9NP56 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDE7BQ9NP56 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE7BQ9NP56 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE7BQ9NP56 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE7BQ9NP56 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE7BQ9NP56 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE7BQ9NP56 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE7BQ9NP56 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE7BQ9NP56 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE7BQ9NP56 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE7BQ9NP56 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE7BQ9NP56 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE7BQ9NP56 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE7BQ9NP56 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE7BQ9NP56 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE7BQ9NP56 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE7BQ9NP56 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE7BQ9NP56 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE7BQ9NP56 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE7BQ9NP56 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE7BQ9NP56 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE7BQ9NP56 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE7BQ9NP56 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE7BQ9NP56 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE7BQ9NP56 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE7BQ9NP56 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE7BQ9NP56 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE7BQ9NP56 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE7BQ9NP56 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE7BQ9NP56 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE7BQ9NP56 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE7BQ9NP56 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE7BQ9NP56 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE7BQ9NP56 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE7BQ9NP56 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE7BQ9NP56 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE7BQ9NP56 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE7BQ9NP56 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE7BQ9NP56 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE7BQ9NP56 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE7BQ9NP56 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE7BQ9NP56 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE7BQ9NP56 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE7BQ9NP56 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE7BQ9NP56 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE7BQ9NP56 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE7BQ9NP56 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE7BQ9NP56 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE7BQ9NP56 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE7BQ9NP56 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE7BQ9NP56 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE7BQ9NP56 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE7BQ9NP56 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE7BQ9NP56 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE7BQ9NP56 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE7BQ9NP56 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE7BQ9NP56 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE7BQ9NP56 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE7BQ9NP56 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE7BQ9NP56 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE7BQ9NP56 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE7BQ9NP56 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
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