Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PLXNA4Q9HCM2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PLXNA4Q9HCM2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PLXNA4Q9HCM2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PLXNA4Q9HCM2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PLXNA4Q9HCM2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PLXNA4Q9HCM2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PLXNA4Q9HCM2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PLXNA4Q9HCM2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PLXNA4Q9HCM2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PLXNA4Q9HCM2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PLXNA4Q9HCM2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PLXNA4Q9HCM2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PLXNA4Q9HCM2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PLXNA4Q9HCM2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PLXNA4Q9HCM2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PLXNA4Q9HCM2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PLXNA4Q9HCM2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PLXNA4Q9HCM2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PLXNA4Q9HCM2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PLXNA4Q9HCM2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PLXNA4Q9HCM2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PLXNA4Q9HCM2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PLXNA4Q9HCM2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PLXNA4Q9HCM2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLXNA4Q9HCM2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLXNA4Q9HCM2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLXNA4Q9HCM2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLXNA4Q9HCM2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLXNA4Q9HCM2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLXNA4Q9HCM2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PLXNA4Q9HCM2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PLXNA4Q9HCM2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PLXNA4Q9HCM2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PLXNA4Q9HCM2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PLXNA4Q9HCM2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PLXNA4Q9HCM2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PLXNA4Q9HCM2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PLXNA4Q9HCM2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PLXNA4Q9HCM2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PLXNA4Q9HCM2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PLXNA4Q9HCM2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PLXNA4Q9HCM2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PLXNA4Q9HCM2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PLXNA4Q9HCM2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PLXNA4Q9HCM2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PLXNA4Q9HCM2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PLXNA4Q9HCM2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PLXNA4Q9HCM2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PLXNA4Q9HCM2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PLXNA4Q9HCM2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLXNA4Q9HCM2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLXNA4Q9HCM2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLXNA4Q9HCM2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLXNA4Q9HCM2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLXNA4Q9HCM2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLXNA4Q9HCM2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLXNA4Q9HCM2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLXNA4Q9HCM2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLXNA4Q9HCM2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLXNA4Q9HCM2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLXNA4Q9HCM2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLXNA4Q9HCM2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLXNA4Q9HCM2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLXNA4Q9HCM2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLXNA4Q9HCM2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLXNA4Q9HCM2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLXNA4Q9HCM2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PLXNA4Q9HCM2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PLXNA4Q9HCM2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PLXNA4Q9HCM2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PLXNA4Q9HCM2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PLXNA4Q9HCM2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PLXNA4Q9HCM2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PLXNA4Q9HCM2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLXNA4Q9HCM2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLXNA4Q9HCM2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLXNA4Q9HCM2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLXNA4Q9HCM2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLXNA4Q9HCM2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLXNA4Q9HCM2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLXNA4Q9HCM2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLXNA4Q9HCM2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLXNA4Q9HCM2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLXNA4Q9HCM2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLXNA4Q9HCM2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLXNA4Q9HCM2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLXNA4Q9HCM2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLXNA4Q9HCM2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLXNA4Q9HCM2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLXNA4Q9HCM2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLXNA4Q9HCM2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PLXNA4Q9HCM2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PLXNA4Q9HCM2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLXNA4Q9HCM2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PLXNA4Q9HCM2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PLXNA4Q9HCM2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLXNA4Q9HCM2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLXNA4Q9HCM2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PLXNA4Q9HCM2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms