Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAD4

WDR41, WD repeat-containing protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR41Q9HAD4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
WDR41Q9HAD4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
WDR41Q9HAD4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
WDR41Q9HAD4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
WDR41Q9HAD4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
WDR41Q9HAD4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
WDR41Q9HAD4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
WDR41Q9HAD4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
WDR41Q9HAD4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
WDR41Q9HAD4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
WDR41Q9HAD4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
WDR41Q9HAD4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
WDR41Q9HAD4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
WDR41Q9HAD4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
WDR41Q9HAD4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
WDR41Q9HAD4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
WDR41Q9HAD4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR41Q9HAD4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR41Q9HAD4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR41Q9HAD4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR41Q9HAD4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
WDR41Q9HAD4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
WDR41Q9HAD4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
WDR41Q9HAD4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
WDR41Q9HAD4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
WDR41Q9HAD4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
WDR41Q9HAD4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
WDR41Q9HAD4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
WDR41Q9HAD4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
WDR41Q9HAD4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
WDR41Q9HAD4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
WDR41Q9HAD4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
WDR41Q9HAD4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
WDR41Q9HAD4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
WDR41Q9HAD4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
WDR41Q9HAD4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
WDR41Q9HAD4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
WDR41Q9HAD4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
WDR41Q9HAD4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
WDR41Q9HAD4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
WDR41Q9HAD4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
WDR41Q9HAD4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
WDR41Q9HAD4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
WDR41Q9HAD4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
WDR41Q9HAD4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
WDR41Q9HAD4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
WDR41Q9HAD4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
WDR41Q9HAD4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
WDR41Q9HAD4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
WDR41Q9HAD4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
WDR41Q9HAD4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
WDR41Q9HAD4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR41Q9HAD4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR41Q9HAD4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR41Q9HAD4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR41Q9HAD4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR41Q9HAD4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR41Q9HAD4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
WDR41Q9HAD4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
WDR41Q9HAD4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
WDR41Q9HAD4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
WDR41Q9HAD4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR41Q9HAD4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR41Q9HAD4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR41Q9HAD4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR41Q9HAD4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR41Q9HAD4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR41Q9HAD4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR41Q9HAD4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR41Q9HAD4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
WDR41Q9HAD4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
WDR41Q9HAD4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
WDR41Q9HAD4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
WDR41Q9HAD4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WDR41Q9HAD4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WDR41Q9HAD4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WDR41Q9HAD4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
WDR41Q9HAD4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
WDR41Q9HAD4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
WDR41Q9HAD4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
WDR41Q9HAD4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR41Q9HAD4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR41Q9HAD4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR41Q9HAD4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
WDR41Q9HAD4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
WDR41Q9HAD4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
WDR41Q9HAD4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
WDR41Q9HAD4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
WDR41Q9HAD4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR41Q9HAD4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR41Q9HAD4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR41Q9HAD4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR41Q9HAD4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR41Q9HAD4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR41Q9HAD4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR41Q9HAD4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR41Q9HAD4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR41Q9HAD4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR41Q9HAD4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
WDR41Q9HAD4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms