Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2L5

RASSF4, Ras association domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF4Q9H2L5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RASSF4Q9H2L5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RASSF4Q9H2L5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RASSF4Q9H2L5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RASSF4Q9H2L5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RASSF4Q9H2L5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RASSF4Q9H2L5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RASSF4Q9H2L5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RASSF4Q9H2L5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RASSF4Q9H2L5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RASSF4Q9H2L5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RASSF4Q9H2L5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RASSF4Q9H2L5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RASSF4Q9H2L5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RASSF4Q9H2L5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RASSF4Q9H2L5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RASSF4Q9H2L5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RASSF4Q9H2L5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RASSF4Q9H2L5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RASSF4Q9H2L5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RASSF4Q9H2L5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RASSF4Q9H2L5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RASSF4Q9H2L5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RASSF4Q9H2L5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RASSF4Q9H2L5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RASSF4Q9H2L5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RASSF4Q9H2L5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RASSF4Q9H2L5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RASSF4Q9H2L5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RASSF4Q9H2L5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RASSF4Q9H2L5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RASSF4Q9H2L5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RASSF4Q9H2L5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RASSF4Q9H2L5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RASSF4Q9H2L5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RASSF4Q9H2L5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RASSF4Q9H2L5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RASSF4Q9H2L5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RASSF4Q9H2L5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RASSF4Q9H2L5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RASSF4Q9H2L5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RASSF4Q9H2L5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RASSF4Q9H2L5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RASSF4Q9H2L5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
RASSF4Q9H2L5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RASSF4Q9H2L5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RASSF4Q9H2L5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RASSF4Q9H2L5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RASSF4Q9H2L5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RASSF4Q9H2L5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RASSF4Q9H2L5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RASSF4Q9H2L5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RASSF4Q9H2L5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RASSF4Q9H2L5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RASSF4Q9H2L5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RASSF4Q9H2L5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RASSF4Q9H2L5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RASSF4Q9H2L5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RASSF4Q9H2L5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RASSF4Q9H2L5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RASSF4Q9H2L5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RASSF4Q9H2L5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RASSF4Q9H2L5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RASSF4Q9H2L5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RASSF4Q9H2L5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RASSF4Q9H2L5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RASSF4Q9H2L5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RASSF4Q9H2L5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RASSF4Q9H2L5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RASSF4Q9H2L5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RASSF4Q9H2L5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RASSF4Q9H2L5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RASSF4Q9H2L5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RASSF4Q9H2L5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RASSF4Q9H2L5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RASSF4Q9H2L5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RASSF4Q9H2L5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RASSF4Q9H2L5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RASSF4Q9H2L5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RASSF4Q9H2L5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RASSF4Q9H2L5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RASSF4Q9H2L5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RASSF4Q9H2L5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RASSF4Q9H2L5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RASSF4Q9H2L5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RASSF4Q9H2L5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RASSF4Q9H2L5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RASSF4Q9H2L5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RASSF4Q9H2L5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RASSF4Q9H2L5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RASSF4Q9H2L5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RASSF4Q9H2L5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RASSF4Q9H2L5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RASSF4Q9H2L5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RASSF4Q9H2L5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RASSF4Q9H2L5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RASSF4Q9H2L5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RASSF4Q9H2L5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RASSF4Q9H2L5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RASSF4Q9H2L5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms