Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0H3

KLHL25, Kelch-like protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL25Q9H0H3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL25Q9H0H3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL25Q9H0H3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL25Q9H0H3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL25Q9H0H3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL25Q9H0H3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL25Q9H0H3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL25Q9H0H3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL25Q9H0H3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL25Q9H0H3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL25Q9H0H3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL25Q9H0H3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL25Q9H0H3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL25Q9H0H3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL25Q9H0H3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL25Q9H0H3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL25Q9H0H3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL25Q9H0H3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL25Q9H0H3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL25Q9H0H3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL25Q9H0H3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL25Q9H0H3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL25Q9H0H3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL25Q9H0H3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL25Q9H0H3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL25Q9H0H3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL25Q9H0H3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL25Q9H0H3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL25Q9H0H3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL25Q9H0H3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL25Q9H0H3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL25Q9H0H3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL25Q9H0H3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL25Q9H0H3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL25Q9H0H3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL25Q9H0H3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL25Q9H0H3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL25Q9H0H3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL25Q9H0H3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL25Q9H0H3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL25Q9H0H3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL25Q9H0H3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL25Q9H0H3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL25Q9H0H3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL25Q9H0H3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL25Q9H0H3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL25Q9H0H3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL25Q9H0H3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL25Q9H0H3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL25Q9H0H3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL25Q9H0H3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL25Q9H0H3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL25Q9H0H3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL25Q9H0H3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL25Q9H0H3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL25Q9H0H3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL25Q9H0H3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL25Q9H0H3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL25Q9H0H3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL25Q9H0H3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL25Q9H0H3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL25Q9H0H3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL25Q9H0H3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL25Q9H0H3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL25Q9H0H3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL25Q9H0H3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL25Q9H0H3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL25Q9H0H3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL25Q9H0H3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL25Q9H0H3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL25Q9H0H3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL25Q9H0H3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL25Q9H0H3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL25Q9H0H3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL25Q9H0H3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL25Q9H0H3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL25Q9H0H3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL25Q9H0H3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL25Q9H0H3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL25Q9H0H3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL25Q9H0H3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL25Q9H0H3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL25Q9H0H3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL25Q9H0H3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL25Q9H0H3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL25Q9H0H3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL25Q9H0H3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL25Q9H0H3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL25Q9H0H3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL25Q9H0H3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL25Q9H0H3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL25Q9H0H3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL25Q9H0H3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL25Q9H0H3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL25Q9H0H3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL25Q9H0H3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL25Q9H0H3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL25Q9H0H3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL25Q9H0H3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL25Q9H0H3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms