Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ6

CHRNA10, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-10, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA10Q9GZZ6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNA10Q9GZZ6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNA10Q9GZZ6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNA10Q9GZZ6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHRNA10Q9GZZ6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNA10Q9GZZ6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNA10Q9GZZ6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRNA10Q9GZZ6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRNA10Q9GZZ6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRNA10Q9GZZ6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRNA10Q9GZZ6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNA10Q9GZZ6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA10Q9GZZ6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA10Q9GZZ6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA10Q9GZZ6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA10Q9GZZ6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA10Q9GZZ6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA10Q9GZZ6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA10Q9GZZ6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA10Q9GZZ6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA10Q9GZZ6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA10Q9GZZ6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA10Q9GZZ6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA10Q9GZZ6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA10Q9GZZ6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA10Q9GZZ6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA10Q9GZZ6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA10Q9GZZ6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA10Q9GZZ6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA10Q9GZZ6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA10Q9GZZ6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA10Q9GZZ6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA10Q9GZZ6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA10Q9GZZ6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA10Q9GZZ6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA10Q9GZZ6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA10Q9GZZ6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA10Q9GZZ6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA10Q9GZZ6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA10Q9GZZ6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA10Q9GZZ6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA10Q9GZZ6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA10Q9GZZ6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA10Q9GZZ6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA10Q9GZZ6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA10Q9GZZ6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA10Q9GZZ6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA10Q9GZZ6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA10Q9GZZ6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA10Q9GZZ6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA10Q9GZZ6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA10Q9GZZ6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA10Q9GZZ6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA10Q9GZZ6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA10Q9GZZ6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA10Q9GZZ6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNA10Q9GZZ6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNA10Q9GZZ6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNA10Q9GZZ6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNA10Q9GZZ6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNA10Q9GZZ6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNA10Q9GZZ6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNA10Q9GZZ6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNA10Q9GZZ6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNA10Q9GZZ6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNA10Q9GZZ6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA10Q9GZZ6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA10Q9GZZ6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA10Q9GZZ6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA10Q9GZZ6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRNA10Q9GZZ6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRNA10Q9GZZ6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNA10Q9GZZ6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNA10Q9GZZ6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNA10Q9GZZ6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNA10Q9GZZ6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNA10Q9GZZ6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNA10Q9GZZ6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNA10Q9GZZ6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNA10Q9GZZ6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNA10Q9GZZ6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNA10Q9GZZ6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA10Q9GZZ6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA10Q9GZZ6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA10Q9GZZ6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA10Q9GZZ6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA10Q9GZZ6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA10Q9GZZ6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA10Q9GZZ6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA10Q9GZZ6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA10Q9GZZ6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA10Q9GZZ6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA10Q9GZZ6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA10Q9GZZ6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA10Q9GZZ6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA10Q9GZZ6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA10Q9GZZ6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA10Q9GZZ6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNA10Q9GZZ6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNA10Q9GZZ6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
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